32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4637 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4637  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 141 aa  273  5e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  37.4 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1536  PilT domain-containing protein  31.69 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.798578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3094  PilT protein-like  33.33 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2119  PilT protein-like  32.84 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  35.77 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1390  PilT domain-containing protein  33.59 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0930438  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1065  PilT domain-containing protein  35.77 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2905  hypothetical protein  37.07 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225441  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0806  hypothetical protein  37.19 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0040933  hitchhiker  0.00739543 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2863  PilT domain-containing protein  34.85 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0050  hypothetical protein  30.71 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1961  PilT protein domain protein  26.98 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11735  hypothetical protein  33.08 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3783  hypothetical protein  34.82 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873007  decreased coverage  0.000213032 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1203  hypothetical protein  32.56 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0480  PilT protein domain protein  36.3 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3938  PilT protein domain protein  31.78 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2713  PilT protein domain protein  30.39 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0839377  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10065  hypothetical protein  34.19 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6160  PilT protein domain protein  36.44 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2338  conserved hypothetical protein  41.18 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.674166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00310  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  22.58 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0355  PilT protein  34.68 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.922806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1049  PilT domain-containing protein  29.47 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.236676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1407  PilT domain-containing protein  32.09 
 
 		 143 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0599  hypothetical protein  28.3 
 
 		 112 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.459839  normal  0.795702 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1214  PilT domain-containing protein  27.2 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2139  hypothetical protein  27.55 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804085  normal  0.443514 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2726  PilT protein domain protein  32.65 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0340205  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9186  PilT protein, N-terminal  28.99 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0899  PilT domain-containing protein  36.84 
 
 		 121 aa  40  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>