More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4530 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4530  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 
213 aa  441  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2399  GTP cyclohydrolase I  66.49 
 
 
205 aa  273  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2664  GTP cyclohydrolase I  63.73 
 
 
222 aa  271  6e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0491858  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  56.48 
 
 
222 aa  248  6e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0356  GTP cyclohydrolase I  60.75 
 
 
213 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0218515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2222  GTP cyclohydrolase I  61.17 
 
 
269 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0899114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7173  GTP cyclohydrolase I  60.75 
 
 
219 aa  237  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418482  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  59.68 
 
 
213 aa  236  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2540  GTP cyclohydrolase I  61.62 
 
 
269 aa  236  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.131431 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2265  GTP cyclohydrolase I  61.62 
 
 
269 aa  236  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254544  normal  0.204953 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4639  GTP cyclohydrolase I  62.7 
 
 
272 aa  236  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6320  GTP cyclohydrolase I  60.22 
 
 
219 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0252905  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0242  GTP cyclohydrolase I  56.45 
 
 
206 aa  234  6e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  59.14 
 
 
213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1576  GTP cyclohydrolase I  55.84 
 
 
213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.0635518 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  56.99 
 
 
209 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  55.79 
 
 
236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  55.79 
 
 
242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  56.15 
 
 
212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  55.79 
 
 
292 aa  232  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  55.79 
 
 
292 aa  232  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  55.79 
 
 
292 aa  232  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  55.79 
 
 
292 aa  232  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  55.79 
 
 
292 aa  232  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1329  GTP cyclohydrolase I  58.06 
 
 
241 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  55.91 
 
 
212 aa  231  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  53.65 
 
 
234 aa  229  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1657  GTP cyclohydrolase I  56.19 
 
 
234 aa  229  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1649  GTP cyclohydrolase I  57.45 
 
 
242 aa  228  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.993885  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  54.79 
 
 
258 aa  228  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2207  GTP cyclohydrolase I  59.57 
 
 
201 aa  227  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137028  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2184  GTP cyclohydrolase I  55.67 
 
 
229 aa  226  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0182088 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  55.21 
 
 
209 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  55.21 
 
 
209 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  54.64 
 
 
203 aa  225  4e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  54.69 
 
 
209 aa  225  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  55.61 
 
 
211 aa  224  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  55.61 
 
 
211 aa  224  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  54.69 
 
 
210 aa  224  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3872  GTP cyclohydrolase I  54.12 
 
 
229 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  53.77 
 
 
211 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3248  GTP cyclohydrolase I  55.67 
 
 
229 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182392  normal  0.472848 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  55.08 
 
 
211 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4006  GTP cyclohydrolase I  53.01 
 
 
203 aa  223  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580102  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0871  GTP cyclohydrolase I  54.1 
 
 
203 aa  222  3e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5183  GTP cyclohydrolase I  56.22 
 
 
232 aa  221  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58549  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1238  GTP cyclohydrolase I  53.37 
 
 
205 aa  220  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  54.59 
 
 
212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2158  GTP cyclohydrolase I  55.45 
 
 
213 aa  216  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284755  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3114  GTP cyclohydrolase I  55.14 
 
 
234 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  51.61 
 
 
206 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03535  GTP cyclohydrolase I  51.91 
 
 
190 aa  215  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2049  GTP cyclohydrolase I  59.57 
 
 
204 aa  214  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  53.89 
 
 
206 aa  214  9.999999999999999e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1849  GTP cyclohydrolase I  58.51 
 
 
204 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254954  normal  0.0136517 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  55.43 
 
 
190 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1049  GTP cyclohydrolase I  51.43 
 
 
205 aa  207  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.399467  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2007  GTP cyclohydrolase  49.5 
 
 
204 aa  205  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.39333  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1911  GTP cyclohydrolase I  53.04 
 
 
200 aa  202  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493644  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0582  GTP cyclohydrolase  48.51 
 
 
206 aa  201  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.931041  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4064  GTP cyclohydrolase I  50.83 
 
 
197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.999809  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1230  GTP cyclohydrolase  52.84 
 
 
211 aa  200  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1832  GTP cyclohydrolase  47.83 
 
 
210 aa  197  9e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3635  GTP cyclohydrolase  51.67 
 
 
192 aa  195  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  48.19 
 
 
216 aa  181  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  48.86 
 
 
185 aa  180  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 
200 aa  177  7e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  48.6 
 
 
216 aa  176  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  44.56 
 
 
235 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0131  GTP cyclohydrolase I  44.83 
 
 
206 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  47.32 
 
 
219 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  48.55 
 
 
226 aa  175  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  44.44 
 
 
227 aa  174  8e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  48.59 
 
 
218 aa  174  9e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  47.98 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  45 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  42.78 
 
 
187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4307  GTP cyclohydrolase I  45.86 
 
 
219 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32080  GTP cyclohydrolase I  48.91 
 
 
219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1171  GTP cyclohydrolase  44.21 
 
 
198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.121032  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  47.15 
 
 
212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  48.02 
 
 
219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0849  GTP cyclohydrolase I  46.39 
 
 
220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.989382  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  46.41 
 
 
219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  46.96 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  48.6 
 
 
185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  46.73 
 
 
200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  48.3 
 
 
190 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  41.84 
 
 
235 aa  172  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  48.62 
 
 
206 aa  171  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  45.16 
 
 
247 aa  171  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  48.31 
 
 
224 aa  171  9e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  45.66 
 
 
179 aa  171  1e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  47.83 
 
 
201 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  48.37 
 
 
202 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  47.28 
 
 
205 aa  170  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  47.83 
 
 
201 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  47.83 
 
 
201 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  43 
 
 
198 aa  170  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  46.35 
 
 
192 aa  169  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>