23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0916 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0916  C-type cytochrome, putative  100 
 
 		 134 aa  277  4e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0793888  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1322  hypothetical protein  58.93 
 
 		 136 aa  148  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1477  C-type cytochrome, putative  57.5 
 
 		 139 aa  144  5e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.425151  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1289  cytochrome c class I  55.74 
 
 		 139 aa  143  7.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1123  cytochrome c class I  58.18 
 
 		 139 aa  137  7e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0304306  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0434  cytochrome c, class I  61.05 
 
 		 139 aa  136  8.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1269  cytochrome c, class I  53.64 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.433863  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2327  cytochrome c class I  57.01 
 
 		 136 aa  129  9e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1980  C-type cytochrome, putative  61.29 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00873033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0171  C-type cytochrome, putative  50.42 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0268  cytochrome c class I  46.94 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.547245  hitchhiker  0.000676888 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0563  hypothetical protein  53.1 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.178816 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0994  cytochrome c class I  44.44 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00162346  decreased coverage  0.0000785996 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1538  cytochrome c, putative  42.37 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0451  cytochrome c, putative  43.75 
 
 		 132 aa  100  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1577  hypothetical protein  51.52 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1537  cytochrome c, putative  42.55 
 
 		 132 aa  99.4  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0303  hypothetical protein  43.33 
 
 		 176 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.149077  hitchhiker  0.00204866 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1738  C-type cytochrome, putative  27.68 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00460785  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0095  hypothetical protein  31.58 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0396  C-type cytochrome, putative  26.97 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0431  cytochrome c class I  31.86 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  5.40538e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0561  cytochrome c family protein  39.62 
 
 		 559 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>