More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0982 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1313  ISCpe7, transposase  100 
 
 
340 aa  711  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0190357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0982  ISCpe7, transposase  100 
 
 
340 aa  711  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  5.45032e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0947  ISCpe7, transposase  97.94 
 
 
340 aa  699  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0680749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0809  ISCpe7, transposase  98.24 
 
 
340 aa  700  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.313897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0802  ISCpe7, transposase  97.65 
 
 
340 aa  697  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0691516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0784  ISCpe7, transposase  97.94 
 
 
340 aa  698  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.653929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0681  ISCpe7, transposase  97.65 
 
 
340 aa  697  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1537  ISCpe7, transposase  95.88 
 
 
340 aa  682  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.10688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1473  ISCpe7, transposase  98.42 
 
 
253 aa  523  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.804077  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0929  ISCpe7, transposase  97.25 
 
 
186 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0298408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0635  ISCpe7, transposase  97.25 
 
 
186 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0755  integrase catalytic subunit  49.56 
 
 
343 aa  352  5e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.47635e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0674  Integrase catalytic region  46.84 
 
 
353 aa  324  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2640  Integrase catalytic region  46.84 
 
 
353 aa  324  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2422  Integrase catalytic region  46.84 
 
 
353 aa  324  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1944  Integrase catalytic region  46.84 
 
 
353 aa  324  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.704589  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2243  Integrase catalytic region  46.26 
 
 
353 aa  322  8e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.781166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1065  Integrase catalytic region  46.26 
 
 
353 aa  322  8e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.106559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1912  Integrase catalytic region  46.26 
 
 
353 aa  322  8e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0243  Integrase catalytic region  46.26 
 
 
353 aa  322  8e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2179  Integrase catalytic region  46.26 
 
 
353 aa  322  8e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  5.21095e-09  hitchhiker  1.88153e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0037  Integrase catalytic region  46.26 
 
 
353 aa  322  8e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2409  Integrase catalytic region  46.26 
 
 
353 aa  322  8e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0930  ISCpe7, transposase  97.44 
 
 
156 aa  320  2e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00303612  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1189  ISCpe7, transposase  98.03 
 
 
152 aa  313  4e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238866  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0634  ISCpe7, transposase  95.45 
 
 
156 aa  312  6e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1190  ISCpe7, transposase  94.89 
 
 
137 aa  275  1e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0283879  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1472  hypothetical protein  93.59 
 
 
78 aa  154  3e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.380106  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0315  ISCpe7, transposase  30.84 
 
 
316 aa  140  2e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00611234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1412  ISCpe7, transposase  30.84 
 
 
316 aa  140  2e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  6.18416e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0745  ISCpe7, transposase  30.84 
 
 
316 aa  140  2e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  8.15737e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0035  ISCpe7, transposase  30.84 
 
 
316 aa  140  2e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.800546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1078  ISCpe7, transposase  30.84 
 
 
316 aa  140  2e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  1.01857e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1261  ISCpe7, transposase  30.84 
 
 
316 aa  140  2e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  1.18886e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0903  ISCpe7, transposase  31.66 
 
 
312 aa  134  2e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  5.97662e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1361  ISCpe7, transposase  31.66 
 
 
312 aa  134  2e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0203024  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0799  ISCpe7, transposase  31.66 
 
 
312 aa  134  2e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0556  ISCpe7, transposase  31.66 
 
 
312 aa  134  2e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1581  ISCpe7, transposase  31.66 
 
 
312 aa  134  2e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0030  insertion element protein  31.66 
 
 
312 aa  134  2e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  8.55614e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1164  ISCpe7, transposase  31.66 
 
 
312 aa  134  2e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1196  ISCpe7, transposase  31.66 
 
 
312 aa  134  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0337  ISCpe7, transposase  31.66 
 
 
312 aa  134  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.500965  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0422  insertion element protein  31.66 
 
 
312 aa  134  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0727  insertion element protein  31.66 
 
 
312 aa  134  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0078  ISCpe7, transposase  31.66 
 
 
312 aa  134  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.516266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1574  ISCpe7, transposase  31.36 
 
 
312 aa  133  4e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0509  ISCpe7, transposase  31.36 
 
 
312 aa  133  4e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0170  integrase catalytic subunit  36.36 
 
 
319 aa  124  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0337001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0539  transposase  24.27 
 
 
478 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  5.12999e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0694  transposase  24.27 
 
 
478 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.08331e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2050  transposase  24.27 
 
 
478 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  9.63714e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0319  transposase  24 
 
 
470 aa  112  7e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0115  hypothetical protein  33.67 
 
 
261 aa  87.4  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  1.60092e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  29.1 
 
 
235 aa  87  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  30.58 
 
 
233 aa  87  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0386  hypothetical protein  33.67 
 
 
261 aa  86.7  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  37.09 
 
 
180 aa  86.3  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  35.33 
 
 
243 aa  82.4  1e-14  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9042  transposase  35.33 
 
 
238 aa  81.3  2e-14  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  33.16 
 
 
237 aa  81.3  2e-14  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  35.33 
 
 
238 aa  81.3  2e-14  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  33.16 
 
 
237 aa  81.3  2e-14  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  33.16 
 
 
237 aa  81.3  2e-14  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  33.16 
 
 
237 aa  81.3  2e-14  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  33.16 
 
 
237 aa  81.3  2e-14  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  33.16 
 
 
237 aa  81.3  2e-14  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  33.16 
 
 
237 aa  81.3  2e-14  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2762  transposase  29.72 
 
 
251 aa  80.5  4e-14  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297514  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  35.33 
 
 
232 aa  80.1  5e-14  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  30.81 
 
 
234 aa  79.7  7e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  30.81 
 
 
234 aa  79.7  7e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  30.81 
 
 
234 aa  79.7  7e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  30.81 
 
 
234 aa  79.7  7e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  30.81 
 
 
234 aa  79.3  8e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  30.81 
 
 
234 aa  79.3  8e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  30.81 
 
 
234 aa  79.3  8e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  30.81 
 
 
234 aa  79.3  8e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  30.81 
 
 
234 aa  79.3  8e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  30.81 
 
 
234 aa  79.3  8e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  30.81 
 
 
234 aa  79.3  8e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  30.81 
 
 
234 aa  79.3  8e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  28.19 
 
 
226 aa  79.3  9e-14  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  6.56405e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  30.81 
 
 
240 aa  79.3  1e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  30.81 
 
 
240 aa  79  1e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  35.29 
 
 
233 aa  78.6  1e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  35.29 
 
 
233 aa  78.6  1e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  30.81 
 
 
240 aa  79.3  1e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  30.81 
 
 
240 aa  79.3  1e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  35.29 
 
 
233 aa  78.6  1e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  30.81 
 
 
240 aa  79.3  1e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  35.29 
 
 
233 aa  78.6  1e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  30.81 
 
 
240 aa  79.3  1e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  30.81 
 
 
240 aa  79.3  1e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  30.81 
 
 
240 aa  79.3  1e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  30.81 
 
 
240 aa  79.3  1e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  30.81 
 
 
240 aa  79.3  1e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  30.81 
 
 
240 aa  79.3  1e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  30.81 
 
 
240 aa  79.3  1e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  30.81 
 
 
240 aa  79.3  1e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>