29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE01990 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006687  CNE01990  hypothetical protein  100 
 
 		 582 aa  1191    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  26.85 
 
 		 565 aa  64.3  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  23.29 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  24.07 
 
 		 727 aa  62.4  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  23.29 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  24.54 
 
 		 699 aa  61.2  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2016  hypothetical protein  24.86 
 
 		 313 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630199  normal  0.0408186 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50155  chitinase chitin binding glycoside hydrolase family 1  24.27 
 
 		 525 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.487357  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  24.35 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  24.54 
 
 		 729 aa  57.8  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  24.54 
 
 		 729 aa  57.8  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  22.32 
 
 		 1578 aa  56.6  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11063  class III chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03850)  27.51 
 
 		 305 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.111184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  26.01 
 
 		 483 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  26.01 
 
 		 483 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  21.78 
 
 		 803 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  21.16 
 
 		 598 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  20.85 
 
 		 484 aa  53.9  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  24 
 
 		 460 aa  51.2  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2180  glycoside hydrolase family protein  29.61 
 
 		 337 aa  50.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.121353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  23.22 
 
 		 551 aa  47.4  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  22.62 
 
 		 492 aa  46.6  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  24.23 
 
 		 420 aa  47  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  24.04 
 
 		 846 aa  45.8  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  22.63 
 
 		 648 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  24.15 
 
 		 516 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  24.3 
 
 		 846 aa  44.3  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  22.55 
 
 		 543 aa  44.3  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  21.89 
 
 		 848 aa  43.9  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>