25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0007 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0007  putative lipoprotein  100 
 
 
981 aa  1951    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.949934  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0015  hypothetical protein  33.3 
 
 
1073 aa  272  2.9999999999999997e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2158  hypothetical protein  53.01 
 
 
1808 aa  141  6e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  47.59 
 
 
5080 aa  124  7e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0230  hypothetical protein  48.91 
 
 
657 aa  117  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.924729  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1057  putative DNA methylase  28.57 
 
 
1787 aa  114  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  40.51 
 
 
1586 aa  110  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  29.03 
 
 
1538 aa  64.3  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  34.4 
 
 
4854 aa  59.3  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  30.58 
 
 
1806 aa  56.2  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0568  hypothetical protein  30.85 
 
 
1766 aa  55.8  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694762  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  30.58 
 
 
1350 aa  55.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  33.33 
 
 
2542 aa  52.8  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3560  protein of unknown function DUF312  54.55 
 
 
258 aa  51.6  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0567  hypothetical protein  30.77 
 
 
627 aa  50.8  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  32.74 
 
 
4678 aa  48.1  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1054  hypothetical protein  36.09 
 
 
527 aa  47.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  25.51 
 
 
1141 aa  47.8  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0016  hypothetical protein  36.21 
 
 
468 aa  45.8  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  37.5 
 
 
1594 aa  46.2  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  30.7 
 
 
542 aa  46.2  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1313  hypothetical protein  35.79 
 
 
2202 aa  46.2  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  29.7 
 
 
5171 aa  45.1  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2337  hypothetical protein  33.86 
 
 
1035 aa  45.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1311  hypothetical protein  34.95 
 
 
618 aa  45.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0843987  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>