15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1054 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1054  hypothetical protein  100 
 
 		 527 aa  991    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.06 
 
 		 1586 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  28.95 
 
 		 589 aa  57.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3869  Ca 2+ binding protein  27.99 
 
 		 1572 aa  56.2  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385063  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0007  putative lipoprotein  33.62 
 
 		 981 aa  52.8  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.949934  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1057  putative DNA methylase  27.14 
 
 		 1787 aa  51.6  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  28.92 
 
 		 1217 aa  50.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0469  hypothetical protein  34.93 
 
 		 458 aa  48.5  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000719923  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  29.82 
 
 		 2667 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  30.26 
 
 		 5899 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  25.17 
 
 		 1424 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  29.27 
 
 		 5171 aa  45.8  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0015  hypothetical protein  27.86 
 
 		 1073 aa  44.7  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1794  hypothetical protein  30.48 
 
 		 480 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0790951 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0004  hypothetical protein  33.82 
 
 		 414 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>