More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00825 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00825  ribosomal protein L35  100 
 
 		 65 aa  124  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.381879  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  76.56 
 
 		 65 aa  95.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  69.23 
 
 		 65 aa  84.3  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  65.62 
 
 		 64 aa  81.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0994  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  80.5  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  65.62 
 
 		 64 aa  79.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  60.94 
 
 		 64 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 66 aa  72  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 64 aa  70.1  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 65 aa  67  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  58.62 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  54.84 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20440  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.836721  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  58.46 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  61.11 
 
 		 73 aa  63.5  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  56.9 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  55.38 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  54.84 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2380  ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2164  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000105441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1933  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000771602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  56.45 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  56.9 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1872  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2398  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1450  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2467  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110477  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3223  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4614  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.0110084 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3479  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0370445  normal  0.0138501 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  53.03 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28670  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000017021 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2506  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684912  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2852  50S ribosomal protein L35  57.41 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103934 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1579  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  53.45 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1969  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00375988  hitchhiker  0.00635162 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  55.56 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2857  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1978  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378736  normal  0.0703875 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2104  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365417  normal  0.232505 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1579  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  53.45 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0488  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000885309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  48.48 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2301  50S ribosomal protein L35  59.32 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000837102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1645  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354073  normal  0.121255 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3091  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.848097  normal  0.0845178 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1975  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0429  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0449  50S ribosomal protein L35  50.85 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0076  50S ribosomal protein L35  50.85 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1318  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.35652  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2607  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3499  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal  0.184731 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>