More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1725 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1725  putative rhamnosyltransferase  100 
 
 
311 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0378366  normal  0.370128 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  35.76 
 
 
298 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
330 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  33.13 
 
 
324 aa  152  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  30.51 
 
 
342 aa  145  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 
288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  32.53 
 
 
284 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  31.79 
 
 
334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  33.2 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 
489 aa  126  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
303 aa  125  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 
300 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 
302 aa  123  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 
321 aa  122  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2583  glycosyl transferase family 2  32.01 
 
 
330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 
305 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
346 aa  116  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 
314 aa  113  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  28.67 
 
 
841 aa  112  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
722 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 
305 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
300 aa  109  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
455 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
401 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  28.9 
 
 
283 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
293 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
342 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0250  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 
344 aa  107  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000444925  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0584  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
347 aa  106  5e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0121583  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
282 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  27.89 
 
 
313 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
311 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
822 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 
312 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
311 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  28.25 
 
 
838 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  31.22 
 
 
320 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
297 aa  102  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
312 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
319 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  27.14 
 
 
705 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  25.32 
 
 
342 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
307 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
836 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  29.04 
 
 
1739 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
299 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 
1340 aa  99.8  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
322 aa  99  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 
327 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 
308 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
286 aa  98.6  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
319 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  29.88 
 
 
310 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
337 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  28.99 
 
 
339 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
310 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  26.87 
 
 
358 aa  95.9  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  28.57 
 
 
339 aa  95.9  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  24.54 
 
 
355 aa  95.9  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  27.2 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
319 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.47 
 
 
379 aa  94  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  24.73 
 
 
296 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  24.73 
 
 
296 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  24.73 
 
 
296 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
331 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
841 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
318 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  26.42 
 
 
348 aa  92.8  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  24.26 
 
 
652 aa  92.4  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
624 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 
299 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  27.24 
 
 
353 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 
279 aa  90.5  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
679 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
318 aa  90.9  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  27.31 
 
 
338 aa  90.1  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  28.29 
 
 
2401 aa  89.7  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 
703 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 
327 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 
331 aa  89.4  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 
327 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 
336 aa  89.4  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 
994 aa  89  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
360 aa  89  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
339 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.81 
 
 
355 aa  88.2  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
1106 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  26.37 
 
 
339 aa  87.8  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  25.86 
 
 
297 aa  87.4  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  26.38 
 
 
350 aa  87  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
1162 aa  86.7  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>