158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0336 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0336  cytochrome c, class I  100 
 
 		 288 aa  561  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0263  cytochrome c, class I  72.35 
 
 		 293 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0385  cytochrome c, class I  62.16 
 
 		 299 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2999  cytochrome c class I  47.32 
 
 		 319 aa  248  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0221845 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3876  cytochrome c class I  53.36 
 
 		 300 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0061  cytochrome c family protein  52.03 
 
 		 298 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0208  cytochrome c, class I  68.71 
 
 		 180 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4983  cytochrome c, class I  68.55 
 
 		 183 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0315  cytochrome c class I  66.88 
 
 		 179 aa  230  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326458  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0320  cytochrome c, class I  66.88 
 
 		 180 aa  230  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.388168 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3003  cytochrome c family protein  53.54 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0120  cytochrome c family protein  53.54 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3302  cytochrome c family protein  53.54 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.933009  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1534  cytochrome c family protein  53.54 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3990  cytochrome c family protein  53.54 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3918  cytochrome c5  53.2 
 
 		 299 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00486957  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3261  cytochrome c family protein  51.34 
 
 		 300 aa  219  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2904  cytochrome c, class I  50.68 
 
 		 295 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0151  cytochrome c, class I  50.68 
 
 		 295 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0164  cytochrome c class I  50.68 
 
 		 295 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0147  cytochrome c class I  50.34 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206313  normal  0.547254 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0150  cytochrome c class I  48.84 
 
 		 302 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0138  cytochrome c, class I  48.17 
 
 		 302 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0498  cytochrome c class I  71.7 
 
 		 180 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3322  cytochrome c, class I  50.9 
 
 		 297 aa  208  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3473  cytochrome c, class I  51.7 
 
 		 294 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3367  cytochrome c class I  49.47 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4834  cytochrome c class I  59.09 
 
 		 202 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.62683  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3020  cytochrome c class I  48.25 
 
 		 298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3068  cytochrome c family protein  52.73 
 
 		 275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3084  hypothetical protein  45.39 
 
 		 294 aa  192  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1307  cytochrome c class I  61.31 
 
 		 174 aa  186  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.466199 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3542  putative cytochrome  62.2 
 
 		 181 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  37.45 
 
 		 266 aa  139  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0033  cytochrome c, class I  48.75 
 
 		 167 aa  138  8.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.198707  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0029  cytochrome c class I  49.39 
 
 		 163 aa  133  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00298904  hitchhiker  0.00000795968 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3859  cytochrome c5  34.63 
 
 		 206 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000764521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  35.75 
 
 		 185 aa  102  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3330  cytochrome c, class I  60.27 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606623  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2963  hypothetical protein  28.64 
 
 		 537 aa  96.3  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2812  hypothetical protein  28.64 
 
 		 537 aa  96.3  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0996  cytochrome c class I  56.1 
 
 		 103 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0250  cytochrome c class I  47.01 
 
 		 148 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000296226  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3650  cytochrome c class I  47.62 
 
 		 112 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3877  cytochrome c, class I  40.62 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4286  cytochrome c, class I  51.25 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419984 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0180  cytochrome c, class I  51.25 
 
 		 97 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.245077  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4658  cytochrome c, class I  48.75 
 
 		 97 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774786 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  47.83 
 
 		 137 aa  80.5  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0216  cytochrome c class I  51.25 
 
 		 97 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0309264  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3568  cytochrome c, class I  47.5 
 
 		 97 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  52.7 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0183  cellulose binding, type IV  50 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.314607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0191  cytochrome c, class I  52.5 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000235852  hitchhiker  0.00582407 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2304  cytochrome c class I  50 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000896467  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0362  cytochrome c5-like protein  33.33 
 
 		 195 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000104978  hitchhiker  0.00044408 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0425  cytochrome C, class I  48 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.501458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1247  Caa(3)-type oxidase, subunit IV  37.72 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0459  cytochrome c, class I  45.35 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0072  cytochrome c, class I  36.64 
 
 		 136 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663637  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4170  cytochrome c class I  50 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1398  putative cytochrome c-type protein  49.38 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0906233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4058  cytochrome c class I  50 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.435905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0083  putative cytochrome c  46.67 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0246  cytochrome c  49.37 
 
 		 97 aa  77  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00117918  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0170  cytochrome c, class I  35.17 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  32.17 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0233  cytochrome c, class I  46.84 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0215738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0605  cytochrome c, class I  46.58 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00227735  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02091  lipoprotein  48.75 
 
 		 135 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4023  cytochrome c class I  44.58 
 
 		 99 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000136046  hitchhiker  0.0000237935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0229  cytochrome c class I  44.58 
 
 		 99 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000537114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0229  cytochrome c class I  44.58 
 
 		 99 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000024603  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0213  hypothetical protein  44.87 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000412444  hitchhiker  0.00201322 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3726  cytochrome c, class I  43.37 
 
 		 99 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.334938  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0264  cytochrome c  44.58 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0654  cytochrome c class I  45.68 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00078  cytochrome c5  47.22 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4918  putative cytochrome c family protein  46.91 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.840892  hitchhiker  0.00914524 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2464  cytochrome c, class I  45.24 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182087  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0232  cytochrome c, class I  43.37 
 
 		 99 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  unclonable  0.0000000000238576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0227  cytochrome c, class I  43.37 
 
 		 99 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.495989  hitchhiker  0.00493696 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0232  cytochrome c class I  43.37 
 
 		 99 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000496502  normal  0.108907 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0232  cytochrome c, class I  43.37 
 
 		 99 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0199425  unclonable  0.0000000000331566 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1062  cytochrome c class I  48.68 
 
 		 159 aa  72  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1141  cytochrome c, class I  48.68 
 
 		 159 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828692  normal  0.616371 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2463  cytochrome c, class I  48.78 
 
 		 140 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.480155  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2556  cytochrome c5  41.3 
 
 		 135 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0239  cytochrome c5  55.22 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2000  cytochrome c, class I  32.84 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0804521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5103  cytochrome c-type protein  46.48 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00484  cb-type cytochrome oxidase subunit III  45.57 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0917  cytochrome c-555  43.21 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  27.9 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2849  cytochrome c family protein  39.53 
 
 		 95 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000128252  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2655  hypothetical protein  43.24 
 
 		 142 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0152  cytochrome c-555  45.68 
 
 		 110 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110389  normal  0.576701 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0213  cytochrome c class I  43.21 
 
 		 111 aa  68.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2117  cytochrome c class I  43.02 
 
 		 141 aa  68.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000139618  normal  0.419433 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2786  hypothetical protein  43.24 
 
 		 142 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>