251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0214 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0214  TrkA-N  100 
 
 		 224 aa  453  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  60.27 
 
 		 224 aa  274  9e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0459  TrkA-N domain protein  60.09 
 
 		 231 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.821137  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3574  TrkA domain-containing protein  57.01 
 
 		 230 aa  266  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.458769 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1513  TrkA-N domain-containing protein  58.37 
 
 		 224 aa  251  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3347  TrkA domain-containing protein  54.84 
 
 		 228 aa  249  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3145  TrkA-N domain protein  54.84 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.436065 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24350  K+ transport system, NAD-binding component  56.74 
 
 		 221 aa  246  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18040  K+ transport system, NAD-binding component  52.73 
 
 		 225 aa  238  5e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06980  K+ transport system, NAD-binding component  54.17 
 
 		 232 aa  238  8e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0398  TrkA-N  50.23 
 
 		 224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81484  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2747  TrkA-N domain protein  53.46 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0359063  hitchhiker  0.0000719315 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0428  TrkA-N domain protein  51.56 
 
 		 225 aa  233  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  51.42 
 
 		 220 aa  228  5e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  52.49 
 
 		 222 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  51.13 
 
 		 224 aa  226  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3270  TrkA-N domain protein  53.3 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.588488  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2303  putative cation transporter  51.83 
 
 		 222 aa  221  8e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  51.2 
 
 		 223 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6144  TrkA-N  50.71 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674267  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0505  TrkA-N domain protein  48.37 
 
 		 254 aa  214  9e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0590826 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0443  TrkA domain-containing protein  50.95 
 
 		 222 aa  210  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103493 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  49.76 
 
 		 213 aa  205  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0372  TrkA domain-containing protein  49.76 
 
 		 222 aa  202  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.849541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24440  K+ transport system, NAD-binding component  49.3 
 
 		 222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.800738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4247  TrkA-N domain protein  48.82 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.61262 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0796  Trk-type K+ transport systems membrane component  41.12 
 
 		 220 aa  175  6e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  38.43 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  41.15 
 
 		 215 aa  172  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  37.96 
 
 		 221 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  40.38 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  38.79 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  38.79 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  38.79 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  38.79 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  38.79 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  38.79 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  38.79 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  38.79 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  38.79 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  38.32 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14840  K+ transport system, NAD-binding component  39.73 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.289305  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  37.5 
 
 		 221 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  40.67 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  36.84 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  40 
 
 		 221 aa  155  6e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  33.8 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  35.68 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  36.87 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  36.71 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  37.2 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  36.06 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  36.06 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  35.58 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  35.87 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  36.1 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  35.32 
 
 		 219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  32.2 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  30.33 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000130553  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  32.27 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  33.18 
 
 		 218 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  34.29 
 
 		 221 aa  128  7.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  35.24 
 
 		 233 aa  128  8.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001288  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  31.28 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.91889  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  31.4 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1273  TrkA-N  33.81 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0458  potassium uptake protein KtrA  35.24 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4052  TrkA-N domain protein  32.06 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4091  TrkA-N domain protein  32.06 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0232188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004055  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  34.31 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248543  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  33.95 
 
 		 223 aa  125  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  33.01 
 
 		 231 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4480  TrkA domain-containing protein  30.33 
 
 		 217 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000127966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4804  TrkA-N  30.91 
 
 		 231 aa  121  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0519  TrkA-N domain protein  32.26 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.416454  normal  0.506126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0566  potassium uptake protein TrkA, putative  33.49 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0952  TrkA-N domain protein  31.13 
 
 		 217 aa  118  6e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2828  TrkA-N domain protein  32.08 
 
 		 250 aa  118  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  33.49 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1557  TrkA domain-containing protein  32.21 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.176981  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01407  hypothetical protein  31.86 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  33.65 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0630  TrkA-N domain protein  34.29 
 
 		 219 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.208337  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0750  TrkA domain-containing protein  31.92 
 
 		 217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.803573  normal  0.253071 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0728  TrkA-N domain protein  34.74 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.439731  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  33.99 
 
 		 218 aa  115  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0012  TrkA-N domain protein  30.84 
 
 		 216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  38.24 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  33.65 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4281  potassium uptake protein KtrA, putative  27.01 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0050  TrkA domain-containing protein  29.2 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0058  TrkA domain-containing protein  29.2 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000170567 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2522  TrkA domain-containing protein  34.55 
 
 		 221 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000136868  normal  0.0316786 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0052  TrkA domain-containing protein  28.76 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000156349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1585  TrkA-N domain protein  29.72 
 
 		 216 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453253  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0047  TrkA domain-containing protein  27.88 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0055  TrkA domain-containing protein  29.2 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000827601 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0137  TRK system potassium uptake protein TrkA, putative  32.56 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0054  TrkA-N domain protein  27.88 
 
 		 232 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0050  TrkA domain-containing protein  29.2 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>