More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6193 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_3951  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  47.53 
 
 
868 aa  724  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  47.58 
 
 
822 aa  736  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0954  ATP-dependent chaperone ClpB  46 
 
 
872 aa  738  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  50.75 
 
 
811 aa  775  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1907  ATP-dependent chaperone ClpB  47.6 
 
 
864 aa  724  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442635 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2646  ATP-dependent chaperone ClpB  51.63 
 
 
860 aa  704  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  46.66 
 
 
823 aa  695  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0899  ATPase AAA-2 domain protein  63.24 
 
 
894 aa  1142  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  4.1024e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0111  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  50.63 
 
 
811 aa  772  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2403  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3521  ATP-dependent chaperone ClpB  48.55 
 
 
866 aa  718  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0824402  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1762  ATP-dependent chaperone ClpB  45.74 
 
 
867 aa  691  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0666  chaperone ClpB (heat-shock protein)  50.53 
 
 
861 aa  700  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00205546  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0413  ATP-dependent chaperone ClpB  47 
 
 
870 aa  699  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1489  ATPase AAA-2 domain protein  46.3 
 
 
813 aa  732  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3145  ATP-dependent chaperone ClpB  50 
 
 
861 aa  691  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.263626  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0330  ATPase AAA-2 domain protein  44.5 
 
 
849 aa  690  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.711717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4921  ATP-dependent chaperone ClpB  45.99 
 
 
879 aa  714  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289151  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  48.71 
 
 
821 aa  741  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2625  ATP-dependent chaperone ClpB  50 
 
 
874 aa  704  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0502533 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5224  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  50.57 
 
 
811 aa  774  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  5.55448e-05  unclonable  1.16962e-24 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0817  ATP-dependent chaperone ClpB  51.47 
 
 
859 aa  698  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.220377  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00870  ATPase AAA-2 domain protein  49.94 
 
 
806 aa  717  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.09164e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0327  ATPase AAA-2 domain protein  49.25 
 
 
810 aa  771  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00200367  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5381  ATP-dependent chaperone ClpB  50 
 
 
878 aa  704  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0414  ATP-dependent chaperone ClpB  47.12 
 
 
870 aa  700  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3479  ATP-dependent chaperone ClpB  46.6 
 
 
880 aa  697  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0332  ATPase AAA-2 domain protein  46.82 
 
 
830 aa  708  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  48.96 
 
 
825 aa  751  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4582  ATP-dependent chaperone ClpB  45.45 
 
 
899 aa  696  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.994728  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2208  ATP-dependent chaperone ClpB  46.37 
 
 
863 aa  721  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1850  ATPase AAA-2 domain protein  47.48 
 
 
826 aa  724  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1436  ATPase AAA-2 domain protein  48.29 
 
 
834 aa  709  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.327817 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0314  ATP-dependent chaperone ClpB  47.24 
 
 
861 aa  723  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174502  normal  0.43861 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2814  ATP-dependent chaperone ClpB  46.28 
 
 
864 aa  710  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.72053e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0389  ATPase AAA-2 domain protein  49.57 
 
 
826 aa  757  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0666957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0091  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  50.63 
 
 
811 aa  772  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.7884e-59 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1042  hypothetical protein  44.63 
 
 
867 aa  696  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1585  ATP-binding subunit of Clp protease  45.68 
 
 
889 aa  700  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1575  ATPase AAA-2 domain protein  49.24 
 
 
814 aa  744  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3720  ATP-dependent chaperone ClpB  46.53 
 
 
857 aa  694  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00907871  normal  0.367074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5444  ATP-dependent chaperone ClpB  50.78 
 
 
874 aa  714  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1438  ATPase  48.12 
 
 
791 aa  715  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0054  ATPase  49.19 
 
 
792 aa  704  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000677637  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0452  ATPase  47.64 
 
 
862 aa  702  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  50.13 
 
 
812 aa  775  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  50.37 
 
 
816 aa  758  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  50.75 
 
 
811 aa  776  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2346  ATP-dependent chaperone ClpB  50.13 
 
 
874 aa  705  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.325239 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5411  ATPase  84.46 
 
 
953 aa  1510  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0379558 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2291  ATPase  67.1 
 
 
566 aa  717  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3819  ATP-dependent chaperone ClpB  45.23 
 
 
861 aa  688  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0624258  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3461  ATPase  46.86 
 
 
824 aa  721  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.385513  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10981  ClpC  45.2 
 
 
859 aa  709  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.518332  normal  0.298944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0028  ATPase  46.07 
 
 
822 aa  689  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  46.98 
 
 
844 aa  706  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5085  ATP-dependent chaperone ClpB  50.19 
 
 
878 aa  702  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7086  ATPase  84.39 
 
 
946 aa  1493  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355216  normal  0.126483 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1850  ATP-dependent Clp protease subunit  48.28 
 
 
861 aa  690  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.808048  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3729  ATP-dependent chaperone ClpB  46.68 
 
 
874 aa  701  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2302  ATP-dependent chaperone ClpB  50 
 
 
874 aa  701  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409555  normal  0.0500216 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  49.33 
 
 
814 aa  769  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02158  ATP-dependent chaperone ClpB  49.11 
 
 
898 aa  690  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.46606  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1210  ATP-dependent chaperone ClpB  50.45 
 
 
862 aa  692  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.890836  normal  0.0751244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1813  ATP-dependent chaperone ClpB  48.87 
 
 
865 aa  701  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.264392 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6193  ATPase AAA-2 domain protein  100 
 
 
930 aa  1873  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809707  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5492  ATPase AAA-2 domain protein  58.24 
 
 
944 aa  1048  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.311641  normal  0.315903 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1526  ATPase  46.2 
 
 
839 aa  716  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00101266  unclonable  2.18976e-18 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6891  ATPase  58.28 
 
 
944 aa  1049  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440431  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5495  ATPase  62.08 
 
 
902 aa  1086  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0938  ATP-dependent chaperone ClpB  49.68 
 
 
865 aa  704  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.651137 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0823  ATP-dependent chaperone ClpB  48.18 
 
 
865 aa  718  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457177  normal  0.714446 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1779  ATP-dependent chaperone ClpB  48.88 
 
 
861 aa  694  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.772911  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6417  ATPase  81.55 
 
 
953 aa  1475  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283675  normal  0.243039 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2019  ATP-dependent chaperone ClpB  50.32 
 
 
865 aa  696  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.82296 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2308  ATPase  49.11 
 
 
848 aa  743  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  48.51 
 
 
824 aa  745  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  46.05 
 
 
868 aa  705  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.86 
 
 
862 aa  691  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0092  ATP-dependent chaperone protein ClpB  45.74 
 
 
864 aa  698  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0030598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  46.99 
 
 
835 aa  731  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0525  ATPase AAA-2  50.19 
 
 
860 aa  693  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_56  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  48.95 
 
 
824 aa  729  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1194  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  46.59 
 
 
812 aa  701  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.453766  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  46.13 
 
 
852 aa  719  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1399  ATPase AAA-2 domain protein  47.72 
 
 
815 aa  709  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1349  ATPase AAA-2 domain protein  49.01 
 
 
820 aa  728  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1216  ATP-dependent chaperone ClpB  45.84 
 
 
867 aa  707  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1402  ATPase AAA-2 domain protein  48.67 
 
 
819 aa  712  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.515013  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  46.33 
 
 
858 aa  711  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  46.39 
 
 
837 aa  725  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2966  ATPase AAA-2 domain protein  50.64 
 
 
842 aa  798  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00321823  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2465  ATP-dependent chaperone ClpB  48.51 
 
 
880 aa  714  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  47.2 
 
 
841 aa  723  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2062  ATPase AAA-2 domain protein  52.67 
 
 
847 aa  776  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.587119  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3836  ATPase AAA-2 domain-containing protein  50.55 
 
 
825 aa  768  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493394  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2309  ATP-dependent chaperone ClpB  45.57 
 
 
872 aa  723  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1000  ATPase AAA-2 domain-containing protein  46.32 
 
 
815 aa  691  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0499037  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09888  putative heat shock ClpB protein  45.62 
 
 
893 aa  691  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0416  ATP-dependent chaperone ClpB  50.9 
 
 
855 aa  698  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0483677 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5467  ATP-dependent chaperone ClpB  46.59 
 
 
871 aa  690  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.184424  normal  0.486747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>