More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4940 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  49.29 
 
 		 928 aa  859    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0767  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  47.81 
 
 		 923 aa  796    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  81.62 
 
 		 978 aa  1687    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  55.52 
 
 		 958 aa  1077    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  81.62 
 
 		 978 aa  1689    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  80.95 
 
 		 978 aa  1659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 974 aa  2021    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  50 
 
 		 935 aa  911    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  49.14 
 
 		 932 aa  877    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  55.4 
 
 		 968 aa  1050    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  95.89 
 
 		 974 aa  1952    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  54.61 
 
 		 974 aa  1034    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  81.06 
 
 		 978 aa  1650    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  82.64 
 
 		 978 aa  1700    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  64.08 
 
 		 961 aa  1281    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  70.29 
 
 		 953 aa  1421    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  81.52 
 
 		 973 aa  1684    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  68.3 
 
 		 979 aa  1359    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  70.79 
 
 		 981 aa  1402    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  69.76 
 
 		 969 aa  1426    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  54.07 
 
 		 973 aa  991    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  69.97 
 
 		 981 aa  1385    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  81.62 
 
 		 973 aa  1686    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  81.62 
 
 		 973 aa  1688    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  81.62 
 
 		 973 aa  1686    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  81.62 
 
 		 973 aa  1687    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0612  conserved hypothetical protein  26.63 
 
 		 1426 aa  273  1e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0814  anaerobic dehydrogenase  26.62 
 
 		 1434 aa  269  2e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0197792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  26.11 
 
 		 833 aa  211  6e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 		 858 aa  194  9e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  27.62 
 
 		 812 aa  181  4e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  24.5 
 
 		 837 aa  180  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  27.41 
 
 		 817 aa  177  6e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  25.09 
 
 		 856 aa  171  7e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2042  twin-arginine translocation pathway signal  26.47 
 
 		 930 aa  170  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.607166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  22.98 
 
 		 934 aa  167  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1335  molybdopterin oxidoreductase  26.1 
 
 		 928 aa  165  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374333  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2453  molybdopterin oxidoreductase  26.13 
 
 		 909 aa  165  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  24.64 
 
 		 917 aa  164  6e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  24.04 
 
 		 1155 aa  164  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0619  molybdopterin oxidoreductase  24.65 
 
 		 911 aa  160  9e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0954  twin-arginine translocation pathway signal  27.45 
 
 		 927 aa  159  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.323124  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1863  molybdopterin oxidoreductase  24.96 
 
 		 932 aa  156  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  24.83 
 
 		 805 aa  154  5e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  25.06 
 
 		 805 aa  155  5e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  24.76 
 
 		 1148 aa  153  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  23.85 
 
 		 781 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2426  molybdopterin oxidoreductase  22.66 
 
 		 826 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242196 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3636  molybdopterin oxidoreductase  26.49 
 
 		 765 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1507  molybdopterin oxidoreductase  24.01 
 
 		 915 aa  146  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.498476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22240  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  23.4 
 
 		 836 aa  145  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.17201 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11280  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.55 
 
 		 864 aa  146  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0470  molybdopterin oxidoreductase  22.38 
 
 		 855 aa  145  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  26.16 
 
 		 910 aa  144  9e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0307  molybdopterin oxidoreductase  23.41 
 
 		 938 aa  144  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000512628  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0199  molybdopterin oxidoreductase  23.18 
 
 		 917 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  32.65 
 
 		 722 aa  142  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  25.74 
 
 		 807 aa  142  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  25.48 
 
 		 803 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1208  molybdopterin oxidoreductase  25.3 
 
 		 947 aa  140  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.28 
 
 		 1020 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.28 
 
 		 1020 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  25.46 
 
 		 1138 aa  137  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1629  molybdopterin oxidoreductase  28.45 
 
 		 789 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0897  tetrathionate reductase, subunit A  24.27 
 
 		 1029 aa  136  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797102  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2385  molybdopterin oxidoreductase  23.06 
 
 		 839 aa  135  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0793925 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4785  molydopterin dinucleotide-binding region  22.39 
 
 		 1031 aa  134  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.57 
 
 		 826 aa  133  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0479  molybdopterin oxidoreductase  27.27 
 
 		 784 aa  133  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2959  molybdopterin oxidoreductase  23.7 
 
 		 913 aa  132  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.791344  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  22.94 
 
 		 879 aa  132  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  24.45 
 
 		 803 aa  132  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1597  molybdopterin oxidoreductase  23.6 
 
 		 800 aa  131  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2177  sulfur reductase, molybdopterin subunit  23.59 
 
 		 909 aa  130  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3826  molybdopterin oxidoreductase  21.62 
 
 		 854 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185272  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1869  molybdopterin oxidoreductase  29.56 
 
 		 800 aa  130  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0325829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2341  molybdopterin oxidoreductase  21.62 
 
 		 854 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.064973  normal  0.0429388 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1835  molybdopterin oxidoreductase  23.59 
 
 		 916 aa  130  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.357483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0643  molybdopterin oxidoreductase  22.42 
 
 		 866 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1181  molybdopterin oxidoreductase  23.5 
 
 		 1073 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20860  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.48 
 
 		 942 aa  128  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1386  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE  22.95 
 
 		 799 aa  125  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0163  molybdopterin oxidoreductase  21.67 
 
 		 851 aa  125  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0917  molybdopterin oxidoreductase  22.47 
 
 		 1022 aa  125  4e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.2527  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2934  formate dehydrogenase  23.99 
 
 		 953 aa  125  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2922  molybdopterin oxidoreductase  25.12 
 
 		 777 aa  125  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.811962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  31.78 
 
 		 759 aa  125  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27730  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  29.14 
 
 		 801 aa  124  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.953321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  28.63 
 
 		 731 aa  124  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  31.64 
 
 		 739 aa  124  8e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  30.36 
 
 		 732 aa  124  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0422  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  24.49 
 
 		 806 aa  124  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0580651  decreased coverage  0.000000000595111 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13690  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  22.62 
 
 		 871 aa  124  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  31.13 
 
 		 744 aa  124  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1741  putative tetrathionate reductase, subunit A  24.79 
 
 		 1038 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0511  molydopterin dinucleotide-binding region  24.11 
 
 		 994 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0709241  normal  0.262694 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1955  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.95 
 
 		 1009 aa  122  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  30.17 
 
 		 731 aa  122  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  32.13 
 
 		 691 aa  122  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1020  molydopterin dinucleotide-binding region  24 
 
 		 977 aa  122  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.961186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>