235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2501 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2501  RNA-binding S4 domain-containing protein  100 
 
 		 149 aa  300  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.157216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0734  RNA-binding S4 domain protein  83.7 
 
 		 135 aa  234  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2329  heat shock protein 15  81.34 
 
 		 135 aa  230  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3325  heat shock protein 15  81.34 
 
 		 135 aa  230  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3964  putative heat shock protein 15  83.7 
 
 		 135 aa  230  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0497  heat shock protein 15  81.34 
 
 		 135 aa  230  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.673566  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1102  heat shock protein 15  81.34 
 
 		 135 aa  230  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.346027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3281  heat shock protein 15  81.34 
 
 		 135 aa  230  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3314  heat shock protein 15  81.34 
 
 		 135 aa  230  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2209  heat shock protein 15  81.34 
 
 		 135 aa  230  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2637  RNA-binding S4 domain-containing protein  82.84 
 
 		 135 aa  229  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3836  RNA-binding S4  80.6 
 
 		 135 aa  224  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1304  heat shock protein 15  78.36 
 
 		 135 aa  224  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0641  RNA-binding S4 domain-containing protein  77.14 
 
 		 157 aa  223  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0665  RNA-binding S4 domain-containing protein  78.36 
 
 		 135 aa  223  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0263  RNA-binding S4  78.36 
 
 		 135 aa  221  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0747  RNA-binding S4 domain-containing protein  78.36 
 
 		 135 aa  221  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.503491  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0717  RNA-binding S4 domain-containing protein  78.36 
 
 		 135 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2876  RNA-binding S4 domain protein  59.38 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2470  RNA-binding S4 domain protein  59.38 
 
 		 132 aa  158  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2642  putative heat shock protein 15  59.38 
 
 		 131 aa  156  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1002  RNA-binding S4  58.73 
 
 		 131 aa  150  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0509  RNA-binding S4 protein  49.61 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.916368  normal  0.173554 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1038  RNA-binding S4  51.64 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0206  RNA-binding S4  50 
 
 		 122 aa  127  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2640  RNA-binding S4  54.84 
 
 		 141 aa  124  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414836  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1231  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.4 
 
 		 138 aa  120  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.984155  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0791  RNA-binding S4 domain protein  49.59 
 
 		 133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2515  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.82 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2006  RNA-binding S4  50.81 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0884  RNA-binding S4 domain protein  50 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3977  RNA-binding S4  50 
 
 		 123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  50 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2419  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.66 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3698  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.53 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1959  RNA-binding S4 domain protein  48.03 
 
 		 167 aa  107  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0257024  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1639  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.88 
 
 		 141 aa  102  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.290258 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2496  putative heat shock protein  49.22 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2075  RNA-binding S4 domain protein  47.5 
 
 		 134 aa  100  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142935  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1162  RNA-binding S4 domain protein  43.97 
 
 		 135 aa  100  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1173  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.74 
 
 		 136 aa  99.4  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116219 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2572  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.18 
 
 		 153 aa  98.6  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000329633 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02152  putative heat shock protein 15-like protein  43.7 
 
 		 176 aa  98.6  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0016  RNA-binding S4  45.08 
 
 		 125 aa  94.4  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1265  RNA-binding S4  43.65 
 
 		 131 aa  92  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1368  RNA-binding S4 domain protein  48.42 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03954  heat shock protein 15  38.93 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3625  putative heat shock protein  42.28 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2659  RNA-binding S4  40.65 
 
 		 130 aa  88.2  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.793293  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0870  RNA-binding S4  41.54 
 
 		 132 aa  87  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.774132  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0950  heat shock RNA-binding protein  41.18 
 
 		 146 aa  86.7  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2048  RNA-binding S4 domain protein  53.75 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1468  RNA-binding S4  37.59 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.369867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1817  heat shock protein 15  45.08 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0275  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.52 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4962  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.19 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0250  RNA-binding S4 domain protein  42.52 
 
 		 133 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0157296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0265  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.52 
 
 		 133 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.664213 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0574  RNA-binding S4  39.83 
 
 		 124 aa  83.6  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000475662  unclonable  0.0000000209736 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0237  heat shock protein 15  45.16 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0170  RNA-binding S4  44.35 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0019  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.16 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.329407  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5939  putative heat shock protein  43.61 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0265  RNA-binding S4  41.22 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293458 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0119  RNA-binding S4  38.4 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0359647  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2104  RNA-binding S4 domain protein  38.58 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0365  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.86 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0776  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.5 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00252001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68630  putative heat shock protein  41.91 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05160  heat shock protein implicated in 50S component recycling (S4 paralogue)  41.88 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0946751  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3752  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.65 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0165  heat shock protein 15  33.33 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0249  RNA-binding S4 domain protein  40.62 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2926  heat shock protein 15  40.16 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1704  S4 domain-containing protein  37.31 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000120647  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0167  heat shock protein 15  36.89 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0728996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0095  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.52 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3816  RNA-binding S4 domain protein  40.3 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0228  RNA-binding S4  38.79 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1769  S4 domain-containing protein  37.31 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00186229  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2308  hypothetical protein  40.34 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0103  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.93 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3778  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  36.09 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3872  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  36.09 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0313  RNA-binding S4 domain protein  36.09 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0313  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  36.09 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0933812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4705  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  36.09 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.39239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3678  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  36.09 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479283 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3596  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  36.09 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0164  heat shock protein 15  34.71 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1408  RNA-binding S4 domain protein  37.1 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3569  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.96 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0348447  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3694  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  37.6 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1697  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.94 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285341 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4348  hypothetical protein  36.51 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874214  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2293  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.86 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0107303  normal  0.537391 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4145  RNA-binding S4 domain protein  38.81 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00358157  normal  0.0781043 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3696  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  37.6 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0464  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.6 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3769  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  37.6 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.594721  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>