More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0090 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0090  CheW protein  100 
 
 
176 aa  352  1e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  37.5 
 
 
159 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  31.97 
 
 
161 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  37.5 
 
 
159 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  33.11 
 
 
150 aa  88.6  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  37.5 
 
 
159 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  36.61 
 
 
159 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0320  CheW protein  33.81 
 
 
160 aa  88.6  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  31.55 
 
 
164 aa  88.6  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  32.48 
 
 
162 aa  87.4  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  36.61 
 
 
159 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.61 
 
 
159 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  36.61 
 
 
159 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  39.62 
 
 
163 aa  87.4  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  34.82 
 
 
165 aa  87.4  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  36.61 
 
 
159 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  35.71 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  38.68 
 
 
163 aa  86.3  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  35.51 
 
 
178 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  28.57 
 
 
155 aa  86.3  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  38.32 
 
 
164 aa  86.7  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  31.91 
 
 
162 aa  86.7  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.32 
 
 
164 aa  85.9  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  36.36 
 
 
159 aa  85.9  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  38.32 
 
 
164 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  38.32 
 
 
164 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  38.32 
 
 
164 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  38.32 
 
 
164 aa  85.1  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  34.78 
 
 
178 aa  85.5  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  38.21 
 
 
167 aa  85.1  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  38.21 
 
 
167 aa  85.1  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  38.21 
 
 
167 aa  85.1  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  38.21 
 
 
167 aa  85.1  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  39.81 
 
 
177 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  37.74 
 
 
161 aa  85.1  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  39.81 
 
 
177 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  38.21 
 
 
167 aa  85.1  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  39.81 
 
 
171 aa  84.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  39.81 
 
 
171 aa  84.7  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  28.38 
 
 
161 aa  84.3  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.38 
 
 
164 aa  84.3  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  37.19 
 
 
167 aa  84.3  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  29.87 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  39.45 
 
 
175 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  37.38 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  29.45 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  39.81 
 
 
171 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  30.77 
 
 
155 aa  83.6  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  37.19 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  37.19 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  37.19 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  37.19 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  36.89 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  37.19 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  38.14 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  37.38 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  37.38 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  37.19 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  37.38 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  31.08 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  36.45 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  37.19 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  37.19 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  37.19 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  37.38 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.79 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  33.77 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  35.16 
 
 
175 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  35.16 
 
 
175 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  35.16 
 
 
175 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  35.16 
 
 
175 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  35.16 
 
 
175 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  31.82 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  35.16 
 
 
175 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  35.16 
 
 
175 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  31.21 
 
 
164 aa  82  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.74 
 
 
174 aa  82  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  38.89 
 
 
174 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  37.74 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  31.45 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  37.38 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  32.61 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  29.53 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  36.19 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  33.59 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  36.19 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  31.25 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  31.82 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  30.82 
 
 
155 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  35.96 
 
 
161 aa  80.5  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  32.87 
 
 
163 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  30.32 
 
 
161 aa  80.9  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  30.77 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  36.36 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  36.36 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  31.61 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  29.25 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  30.82 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  35.65 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  30.3 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>