More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2827 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
373 aa  762    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  71.58 
 
 
373 aa  528  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  68.95 
 
 
359 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  57.68 
 
 
376 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  54.92 
 
 
371 aa  422  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  54.1 
 
 
376 aa  418  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  54.64 
 
 
371 aa  420  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  50.13 
 
 
369 aa  358  7e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  51.91 
 
 
382 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  49.19 
 
 
380 aa  341  9e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  49.07 
 
 
382 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  43.47 
 
 
377 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  43.97 
 
 
377 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  43.12 
 
 
378 aa  333  3e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  42.93 
 
 
377 aa  333  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  43.54 
 
 
388 aa  330  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  42.36 
 
 
376 aa  328  6e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  43.43 
 
 
377 aa  328  8e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  43.43 
 
 
377 aa  328  8e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  43.43 
 
 
377 aa  328  9e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  40.32 
 
 
371 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  40.05 
 
 
371 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  41.83 
 
 
372 aa  269  5e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  39.47 
 
 
376 aa  262  8e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  36.53 
 
 
390 aa  259  6e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1680  oxidoreductase domain-containing protein  43.98 
 
 
372 aa  259  7e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  38.32 
 
 
387 aa  258  9e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3347  oxidoreductase-like  40.83 
 
 
367 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0144127  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  36.81 
 
 
388 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  40.62 
 
 
419 aa  250  3e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  35.57 
 
 
389 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  39.17 
 
 
367 aa  246  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  36.62 
 
 
390 aa  246  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  37.53 
 
 
387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  35.82 
 
 
389 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  39.36 
 
 
378 aa  239  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  37.8 
 
 
387 aa  239  8e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  38.59 
 
 
386 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  35.09 
 
 
393 aa  237  3e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  38.46 
 
 
378 aa  232  8.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  38.28 
 
 
396 aa  231  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  34.31 
 
 
385 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  35.86 
 
 
395 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  40.9 
 
 
398 aa  227  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  34.55 
 
 
394 aa  224  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  36.27 
 
 
396 aa  223  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  39.67 
 
 
388 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4326  oxidoreductase domain protein  39.53 
 
 
413 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  37.24 
 
 
397 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  37.34 
 
 
397 aa  213  5.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  36.29 
 
 
387 aa  210  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  37.4 
 
 
388 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  33.16 
 
 
385 aa  209  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  37.9 
 
 
398 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  37.9 
 
 
379 aa  206  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  35.56 
 
 
371 aa  205  9e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  36.84 
 
 
393 aa  205  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  33.16 
 
 
386 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  37.66 
 
 
387 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  36.51 
 
 
391 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  36.46 
 
 
403 aa  203  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  35.88 
 
 
382 aa  202  6e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  35.39 
 
 
378 aa  202  9e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  34.76 
 
 
359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3682  oxidoreductase domain-containing protein  37.47 
 
 
418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.595723  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1190  oxidoreductase domain protein  38.11 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103704  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  37.36 
 
 
386 aa  200  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8256  hypothetical protein  35.08 
 
 
409 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0185065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  32.39 
 
 
398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  36.34 
 
 
396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2398  oxidoreductase domain protein  36.53 
 
 
398 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  34.93 
 
 
377 aa  196  6e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  34.17 
 
 
369 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3604  oxidoreductase domain protein  37.17 
 
 
409 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289297  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  33.59 
 
 
385 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0068  oxidoreductase domain protein  35.49 
 
 
409 aa  188  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4617  oxidoreductase domain protein  37.08 
 
 
397 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1811  oxidoreductase domain-containing protein  34.02 
 
 
392 aa  178  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.483948 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  32.32 
 
 
381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  36.75 
 
 
384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  28.88 
 
 
374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  32.48 
 
 
374 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  35.5 
 
 
366 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  35.52 
 
 
382 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  36.23 
 
 
353 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  32.31 
 
 
381 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  28.72 
 
 
378 aa  166  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  35.67 
 
 
382 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  35.03 
 
 
384 aa  152  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  34.15 
 
 
382 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  30.1 
 
 
383 aa  145  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  29.67 
 
 
386 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  30.1 
 
 
383 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  29.97 
 
 
380 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  31.39 
 
 
384 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  30.1 
 
 
377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  28.88 
 
 
348 aa  140  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  29.16 
 
 
384 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.32 
 
 
348 aa  138  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3257  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 
347 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  0.603844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>