More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1052 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1052  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 
259 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.310661  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2899  peptidase M22 glycoprotease  65.53 
 
 
234 aa  285  5e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328536 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3199  peptidase M22 glycoprotease  54.95 
 
 
226 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150243  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3395  peptidase M22 glycoprotease  56.11 
 
 
226 aa  199  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3523  peptidase M22 glycoprotease  55.16 
 
 
226 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.0963127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4430  peptidase M22 glycoprotease  52.61 
 
 
232 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0939599  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1822  peptidase M22 glycoprotease  50.89 
 
 
227 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309714  normal  0.168766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  49.32 
 
 
231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3393  peptidase M22 glycoprotease  51.74 
 
 
231 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0643  peptidase M22 glycoprotease  55.07 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  50.45 
 
 
231 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  49.08 
 
 
232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  47.71 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0042  putative glycoprotease family protein  47.39 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5048  normal  0.440262 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  47.49 
 
 
230 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0456  peptidase M22 glycoprotease  46.96 
 
 
231 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3916  peptidase M22, glycoprotease  39.38 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0023  peptidase M22 glycoprotease  35.71 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0432  hypothetical protein  38.05 
 
 
229 aa  119  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0331052  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0035  peptidase M22 glycoprotease  35.27 
 
 
220 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0037  peptidase M22 glycoprotease  39.73 
 
 
218 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150711 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  36.84 
 
 
229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2150  protease, putative  37.55 
 
 
261 aa  112  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2063  putative protease  37.55 
 
 
261 aa  112  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.273267  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1747  glycoprotein endopeptidase  35.11 
 
 
228 aa  103  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.3762  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  42.94 
 
 
213 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1241  glycoprotease family protein  33.47 
 
 
235 aa  99  6e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3613  peptidase M22 glycoprotease  43.2 
 
 
230 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  30.99 
 
 
238 aa  97.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3763  peptidase M22, glycoprotease  43.89 
 
 
232 aa  92.8  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  40.6 
 
 
231 aa  92.4  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  39.26 
 
 
231 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  39.26 
 
 
231 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1759  hypothetical protein  33.52 
 
 
230 aa  91.3  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.607918  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  39.26 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  39.26 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  39.26 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  35.48 
 
 
231 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  35.48 
 
 
231 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  35.48 
 
 
231 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01960  O-sialoglycoprotein endopeptidase  32.26 
 
 
239 aa  87  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.717624  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  34.5 
 
 
233 aa  87  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0358  peptidase M22, glycoprotease  35.45 
 
 
216 aa  87  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0837171 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  34.84 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  38.51 
 
 
233 aa  86.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  34.84 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  34.84 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  34.84 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  37.88 
 
 
233 aa  86.3  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  34.84 
 
 
231 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  38.64 
 
 
233 aa  85.5  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2808  peptidase M22, glycoprotease  32.6 
 
 
234 aa  85.5  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  37.59 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6548  peptidase M22 glycoprotease  37.5 
 
 
232 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1202  peptidase M22 glycoprotease  32.93 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  31 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0863  peptidase M22, glycoprotease  33.33 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0347  peptidase M22 glycoprotease  34.31 
 
 
241 aa  84  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  35 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  37.16 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  36.43 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  39.57 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0379  metal-dependent protease-like protein, putative molecular chaperone  38.76 
 
 
241 aa  82.8  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.457617  hitchhiker  0.000000359774 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0489  peptidase M22, glycoprotease  33.55 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.650313  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  31.51 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  36.36 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  32.62 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  36.03 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1857  peptidase M22 glycoprotease  34.58 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00567012  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  32.48 
 
 
224 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  31.05 
 
 
223 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0447  glycoprotease family protein  31.41 
 
 
232 aa  81.6  0.00000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  33.04 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  36.03 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1294  peptidase M22 glycoprotease  32.77 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450316  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  31.3 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  36.43 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0614  peptidase M22 glycoprotease  42.96 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725915  normal  0.446641 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  36.43 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  36.43 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  36.43 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  29.96 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1546  peptidase M22 glycoprotease  33.63 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.311826 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0800  peptidase M22 glycoprotease  35.38 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188587  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4457  peptidase M22 glycoprotease  35.34 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  37.23 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  36.92 
 
 
236 aa  79  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  27.92 
 
 
236 aa  79  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  31.91 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  34.59 
 
 
236 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  37.23 
 
 
236 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2146  peptidase M22 glycoprotease  34.83 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.472287  hitchhiker  0.00199457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  38.28 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2213  hypothetical protein  41.5 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1487  peptidase M22, glycoprotease  45.38 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0888  peptidase M22, glycoprotease  41.5 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0332753  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  37.23 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2516  hypothetical protein  34.83 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1786  peptidase M22, glycoprotease  30.08 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0677325  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0730  glycoprotease family protein  28.57 
 
 
195 aa  77  0.0000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>