84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2222 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1055  peptidase M14 carboxypeptidase A  95.56 
 
 
384 aa  741  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387993  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2260  peptidase M14, carboxypeptidase A  96.87 
 
 
384 aa  756  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2246  peptidase M14 carboxypeptidase A  98.7 
 
 
384 aa  793  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222943  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2222  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 
384 aa  800  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1162  zinc carboxypeptidase family protein  85.38 
 
 
384 aa  699  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000370841  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0707  zinc carboxypeptidase family protein  85.64 
 
 
384 aa  701  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1322  zinc carboxypeptidase family protein  85.9 
 
 
384 aa  702  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111007  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1331  zinc carboxypeptidase family protein  85.64 
 
 
384 aa  701  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0445  zinc carboxypeptidase family protein  85.64 
 
 
384 aa  701  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1376  peptidase M14 carboxypeptidase A  82.25 
 
 
384 aa  679  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1978  peptidase M14 carboxypeptidase A  78.81 
 
 
388 aa  654  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228376  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2139  peptidase M14 carboxypeptidase A  96.61 
 
 
384 aa  754  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  normal  0.791166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3179  zinc carboxypeptidase  81.72 
 
 
384 aa  676  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129073  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1798  hypothetical protein  85.38 
 
 
384 aa  699  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117776  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1091  zinc carboxypeptidase family protein  83.81 
 
 
384 aa  668  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175299  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1610  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 
384 aa  800  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1468  peptidase  85.64 
 
 
384 aa  701  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000305268  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5550  peptidase M14, carboxypeptidase A  98.43 
 
 
384 aa  789  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400192  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1839  peptidase M14 carboxypeptidase A  66.76 
 
 
381 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419157  normal  0.0171769 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2163  peptidase M14 carboxypeptidase A  66.22 
 
 
381 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304741  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1015  peptidase M14, carboxypeptidase A  65.43 
 
 
380 aa  523  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0979  peptidase M14, carboxypeptidase A  64.91 
 
 
380 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2008  hypothetical protein  64.89 
 
 
381 aa  508  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0949497 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2160  peptidase M14 carboxypeptidase A  56.4 
 
 
379 aa  433  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.746604  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3575  peptidase M14, carboxypeptidase A  52.74 
 
 
383 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.577581  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2073  peptidase M14 carboxypeptidase A  52.41 
 
 
384 aa  401  1e-110  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378615  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2257  peptidase M14 carboxypeptidase A  49.34 
 
 
375 aa  391  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  3.28738e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1231  peptidase M14, carboxypeptidase A  49.87 
 
 
378 aa  386  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.601484 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1942  peptidase M14, carboxypeptidase A  49.61 
 
 
375 aa  386  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04891  zinc-carboxypeptidase  49.33 
 
 
400 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000756  zinc carboxypeptidase domain protein  49.08 
 
 
374 aa  382  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  3.14112e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2149  peptidase M14, carboxypeptidase A  49.08 
 
 
374 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.385121  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2073  peptidase M14, carboxypeptidase A  50.26 
 
 
375 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0474309  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1960  peptidase M14, carboxypeptidase A  50 
 
 
375 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.240759  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  50.39 
 
 
375 aa  381  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2424  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  49.48 
 
 
375 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  49.48 
 
 
375 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00901911  hitchhiker  1.23678e-05 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01259  predicted carboxypeptidase, Zn dependent  50.27 
 
 
379 aa  377  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59847  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2558  zinc carboxypeptidase family protein  47.92 
 
 
380 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2315  peptidase M14, carboxypeptidase A  48.95 
 
 
375 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  5.68724e-06  hitchhiker  0.00110139 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0079  zinc carboxypeptidase  48.4 
 
 
374 aa  374  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2295  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.91 
 
 
375 aa  368  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00080179  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2415  peptidase M14 carboxypeptidase A  48.17 
 
 
375 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000158665 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0268  peptidase M14, carboxypeptidase A  47.49 
 
 
375 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1465  peptidase M14, carboxypeptidase A  49.21 
 
 
376 aa  371  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000868597  normal  0.0173526 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  47.12 
 
 
375 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2300  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.77 
 
 
375 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000207192  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  47.91 
 
 
376 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11613  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2047  peptidase M14 carboxypeptidase A  48.17 
 
 
375 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  hitchhiker  7.23635e-11 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2051  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.77 
 
 
375 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.888658  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1641  peptidase M14, carboxypeptidase A  46.97 
 
 
375 aa  362  6e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1240  peptidase M14, carboxypeptidase A  46.84 
 
 
379 aa  360  2e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.398831  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3113  peptidase M14, carboxypeptidase A  46.86 
 
 
380 aa  343  3e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  43.39 
 
 
378 aa  326  4e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2832  peptidase M14, carboxypeptidase A  45.48 
 
 
369 aa  325  9e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3662  peptidase M14, carboxypeptidase A  42.56 
 
 
383 aa  319  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  1.73445e-07  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2324  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  42.3 
 
 
375 aa  318  7e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1804  peptidase M14 carboxypeptidase A  41.91 
 
 
382 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0544452  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1964  peptidase M14 carboxypeptidase A  42.02 
 
 
382 aa  313  3e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0593717 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27470  putative zinc carboxypeptidase  41.78 
 
 
375 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152383  normal  0.163866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1338  peptidase M14, carboxypeptidase A  42.02 
 
 
375 aa  310  4e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.412426  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2364  hypothetical protein  42.02 
 
 
382 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0816102  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3278  peptidase M14, carboxypeptidase A  43.01 
 
 
376 aa  308  7e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.546138  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3331  peptidase M14, carboxypeptidase A  41.49 
 
 
382 aa  308  1e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49091  predicted protein  37.25 
 
 
459 aa  259  6e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1582  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.67 
 
 
405 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00197244  normal  0.432396 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0741  hypothetical protein  28.4 
 
 
463 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.849095  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2784  hypothetical protein  26.46 
 
 
340 aa  79  1e-13  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.66 
 
 
398 aa  72.8  1e-11  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.09 
 
 
393 aa  62.8  9e-09  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.94 
 
 
497 aa  54.7  3e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.5 
 
 
406 aa  53.1  8e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.58618e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2692  zinc carboxypeptidase family protein  30.39 
 
 
429 aa  52.4  1e-05  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0016795  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.38 
 
 
384 aa  51.2  3e-05  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  26.5 
 
 
403 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.06 
 
 
557 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  27.07 
 
 
392 aa  47  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  24.84 
 
 
351 aa  47  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  24.56 
 
 
490 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  26.86 
 
 
490 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2367  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.73 
 
 
580 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.639683  normal  0.513126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5095  peptidase, family M14  23.66 
 
 
576 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  5.22149e-07  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  24.5 
 
 
821 aa  43.5  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.48 
 
 
428 aa  43.1  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>