68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2784 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2784  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  696    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2415  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.21 
 
 
375 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000158665 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1839  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.93 
 
 
381 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419157  normal  0.0171769 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2047  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.08 
 
 
375 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  hitchhiker  0.0000000000723635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27470  putative zinc carboxypeptidase  28.2 
 
 
375 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152383  normal  0.163866 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2163  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.3 
 
 
381 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304741  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2051  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.33 
 
 
375 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.888658  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2324  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  27.92 
 
 
375 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2300  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.5 
 
 
375 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000207192  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2315  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.01 
 
 
375 aa  90.9  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000568724  hitchhiker  0.00110139 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0979  peptidase M14, carboxypeptidase A  26 
 
 
380 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0079  zinc carboxypeptidase  27.71 
 
 
374 aa  90.5  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.22 
 
 
378 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1641  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.48 
 
 
375 aa  89.7  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1960  peptidase M14, carboxypeptidase A  31 
 
 
375 aa  89.4  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.240759  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2257  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.69 
 
 
375 aa  89  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328738  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2149  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.4 
 
 
374 aa  89.4  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.385121  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0268  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.87 
 
 
375 aa  88.2  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1231  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.01 
 
 
378 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.601484 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2295  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.54 
 
 
375 aa  87.8  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00080179  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1942  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.1 
 
 
375 aa  87.8  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.31 
 
 
375 aa  87.8  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2073  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.5 
 
 
375 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0474309  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01259  predicted carboxypeptidase, Zn dependent  25.87 
 
 
379 aa  87.4  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59847  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  30.77 
 
 
375 aa  87.4  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04891  zinc-carboxypeptidase  26.9 
 
 
400 aa  87  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1015  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.22 
 
 
380 aa  86.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2260  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.93 
 
 
384 aa  86.3  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2139  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.93 
 
 
384 aa  86.3  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  normal  0.791166 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2424  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  26.13 
 
 
375 aa  85.9  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2008  hypothetical protein  26.73 
 
 
381 aa  85.9  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0949497 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1091  zinc carboxypeptidase family protein  30.81 
 
 
384 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175299  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1055  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.46 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387993  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.55 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11613  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5550  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.46 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400192  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1978  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.19 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228376  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.5 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00901911  hitchhiker  0.0000123678 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1468  peptidase  30.81 
 
 
384 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000305268  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1798  hypothetical protein  30.3 
 
 
384 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117776  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1331  zinc carboxypeptidase family protein  30.81 
 
 
384 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1162  zinc carboxypeptidase family protein  30.3 
 
 
384 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000370841  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0445  zinc carboxypeptidase family protein  30.3 
 
 
384 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1322  zinc carboxypeptidase family protein  30.3 
 
 
384 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111007  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1240  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.13 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.398831  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0707  zinc carboxypeptidase family protein  30.3 
 
 
384 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1610  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.46 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2222  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.46 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2246  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.15 
 
 
384 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222943  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3331  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.79 
 
 
382 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2364  hypothetical protein  25.79 
 
 
382 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0816102  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000756  zinc carboxypeptidase domain protein  26.58 
 
 
374 aa  82  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000314112  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1804  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.2 
 
 
382 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0544452  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3179  zinc carboxypeptidase  25.75 
 
 
384 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129073  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1376  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.15 
 
 
384 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3662  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.45 
 
 
383 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000173445  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2160  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.91 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.746604  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1465  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.38 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000868597  normal  0.0173526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1964  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.94 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0593717 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2558  zinc carboxypeptidase family protein  26.81 
 
 
380 aa  77.4  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49091  predicted protein  29.95 
 
 
459 aa  77.4  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1338  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.51 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.412426  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3113  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.03 
 
 
380 aa  72.8  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3278  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.61 
 
 
376 aa  72.4  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.546138  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2073  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.81 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378615  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2832  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.38 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3575  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.38 
 
 
383 aa  66.2  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.577581  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.48 
 
 
393 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.75 
 
 
398 aa  43.9  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>