39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0791 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0760  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like protein  98.26 
 
 		 344 aa  692    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0791  plasmid-related protein  100 
 
 		 344 aa  703    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.435871  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0308  plasmid-related protein  99.42 
 
 		 344 aa  698    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0462  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like  62.33 
 
 		 349 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4188  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like protein  61.18 
 
 		 351 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.730341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3327  plasmid-related protein  60.86 
 
 		 351 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4839  plasmid-related protein  60.86 
 
 		 351 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.658809  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6491  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like protein  57.86 
 
 		 337 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.440209  normal  0.634473 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2643  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2- like  54.17 
 
 		 337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1768  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like  53.66 
 
 		 337 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330763  normal  0.546869 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0176  Relaxase/mobilization nuclease family protein  58.03 
 
 		 349 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0486311 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0785  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like protein  40.45 
 
 		 321 aa  192  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00514005 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0017  hypothetical protein  38.57 
 
 		 344 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.125294 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6340  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like protein  40.65 
 
 		 367 aa  170  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.271931 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4977  hypothetical protein  43.16 
 
 		 377 aa  143  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4934  relaxase/mobilization nuclease family protein  41.88 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421912  normal  0.821482 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5017  relaxase/mobilization nuclease family protein  45.51 
 
 		 377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2249  Relaxase/mobilization nuclease family protein  43.85 
 
 		 368 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4359  relaxase/mobilization nuclease family protein  38 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.738974 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5826  hypothetical protein  35 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4526  hypothetical protein  39.09 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a001  nickase/relaxase  30.7 
 
 		 438 aa  99.8  6e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0555425  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0150  Cpp17  31.82 
 
 		 416 aa  95.9  8e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000847879  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0012  cpp17  32.22 
 
 		 462 aa  87  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000347998  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6229  hypothetical protein  39.6 
 
 		 668 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.422278 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4527  hypothetical protein  31.73 
 
 		 745 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.820483  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4269  hypothetical protein  32.63 
 
 		 776 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.516015  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0106  relaxase/Mobilization nuclease domain protein  27.93 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392069  normal  0.357718 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8212  type IV secretion system T-DNA border endonuclease VirD2  29.93 
 
 		 403 aa  56.2  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0031  nickase  27.94 
 
 		 409 aa  56.2  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.743382  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9808  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  27.78 
 
 		 920 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3989  relaxase/mobilization nuclease family protein  25 
 
 		 777 aa  50.4  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4553  relaxase/mobilization nuclease family protein  30.56 
 
 		 994 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3656  relaxase/mobilization nuclease family protein  24.58 
 
 		 777 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0486452  decreased coverage  0.000000302342 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4768  hypothetical protein  30.56 
 
 		 996 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439128  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3793  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  26.11 
 
 		 736 aa  47.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00267002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4166  hypothetical protein  29.63 
 
 		 895 aa  47  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6382  hypothetical protein  27.14 
 
 		 830 aa  46.6  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3563  relaxase/mobilization nuclease family protein  27.13 
 
 		 421 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>