41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2765 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2765  hypothetical protein  100 
 
 
634 aa  1239    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1248  Protein of unknown function DUF2207, membrane  47.73 
 
 
652 aa  461  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0661  hypothetical protein  34 
 
 
573 aa  270  5e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0929  hypothetical protein  35.28 
 
 
547 aa  253  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0961263  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0484  hypothetical protein  36.23 
 
 
498 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0480409  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2921  hypothetical protein  32.45 
 
 
581 aa  230  5e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4324  hypothetical protein  32.64 
 
 
613 aa  198  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0859  hypothetical protein  34.28 
 
 
549 aa  160  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00278552  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1259  membrane protein-like protein  27.49 
 
 
649 aa  134  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1466  hypothetical protein  29.05 
 
 
465 aa  88.2  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3926  hypothetical protein  29.41 
 
 
360 aa  85.5  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2685  hypothetical protein  24.91 
 
 
607 aa  84  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.561749  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3732  hypothetical protein  25.17 
 
 
609 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0265858  normal  0.0706106 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0145  hypothetical protein  21.08 
 
 
633 aa  70.9  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2381  hypothetical protein  23.78 
 
 
606 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2428  hypothetical protein  23.78 
 
 
606 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554313  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2636  putative transmembrane signal peptide protein  27.89 
 
 
626 aa  68.2  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2422  hypothetical protein  23.78 
 
 
606 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651701  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0465  putative transmembrane signal peptide protein  26 
 
 
644 aa  66.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.559326  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1377  hypothetical protein  21.74 
 
 
631 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.469999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2360  hypothetical protein  21.74 
 
 
631 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000648065 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3740  hypothetical protein  22.3 
 
 
685 aa  57.8  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0577  hypothetical protein  24.85 
 
 
644 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.464541  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0534  hypothetical protein  24.59 
 
 
644 aa  55.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0514  membrane-like protein  24.3 
 
 
639 aa  55.5  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1493  hypothetical protein  23.5 
 
 
679 aa  55.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0707557  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0399  hypothetical protein  23.5 
 
 
438 aa  54.3  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719971  normal  0.0793773 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1381  hypothetical protein  23.5 
 
 
661 aa  53.9  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2702  hypothetical protein  20.89 
 
 
686 aa  53.9  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.728623  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1067  hypothetical protein  28.16 
 
 
756 aa  53.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1492  hypothetical protein  21.78 
 
 
631 aa  53.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2301  hypothetical protein  21.29 
 
 
676 aa  52.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000179124  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4521  membrane-like protein  25.71 
 
 
656 aa  53.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180216  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1900  hypothetical protein  22.54 
 
 
527 aa  50.8  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000762932 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1865  hypothetical protein  21.12 
 
 
631 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000596823 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2381  conserved hypothetical protein  22.33 
 
 
631 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0833441  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0277  hypothetical protein  18.75 
 
 
586 aa  49.3  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0464  hypothetical protein  21.92 
 
 
566 aa  49.3  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27530  predicted membrane protein  20.76 
 
 
669 aa  47.8  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00352231  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0361  hypothetical protein  20.7 
 
 
607 aa  46.2  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0818  hypothetical protein  22.27 
 
 
543 aa  46.2  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0165146  hitchhiker  0.0000000000172103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>