27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1493 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1493  hypothetical protein  100 
 
 		 679 aa  1380    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0707557  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1381  hypothetical protein  99.7 
 
 		 661 aa  1343    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0399  hypothetical protein  99.77 
 
 		 438 aa  902    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719971  normal  0.0793773 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2702  hypothetical protein  49.16 
 
 		 686 aa  600  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.728623  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3740  hypothetical protein  49.06 
 
 		 685 aa  581  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1926  hypothetical protein  99.16 
 
 		 239 aa  467  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0384615  normal  0.526622 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1377  hypothetical protein  26.72 
 
 		 631 aa  217  5e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.469999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2360  hypothetical protein  27.56 
 
 		 631 aa  213  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000648065 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1492  hypothetical protein  26.55 
 
 		 631 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1865  hypothetical protein  28.82 
 
 		 631 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000596823 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2381  conserved hypothetical protein  27.56 
 
 		 631 aa  194  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0833441  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2636  putative transmembrane signal peptide protein  27.7 
 
 		 626 aa  193  8e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0514  membrane-like protein  27.15 
 
 		 639 aa  172  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4521  membrane-like protein  26.34 
 
 		 656 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1900  hypothetical protein  37.1 
 
 		 527 aa  163  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762932 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0577  hypothetical protein  25.69 
 
 		 644 aa  162  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.464541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0534  hypothetical protein  24.43 
 
 		 644 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01254  hypothetical protein  27.59 
 
 		 438 aa  139  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0465  putative transmembrane signal peptide protein  23.88 
 
 		 644 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.559326  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0576  putative transmembrane signal peptide protein  24.83 
 
 		 652 aa  127  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000285101  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0145  hypothetical protein  29.87 
 
 		 633 aa  102  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0277  hypothetical protein  27.95 
 
 		 586 aa  63.2  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2301  hypothetical protein  19.54 
 
 		 676 aa  58.2  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000179124  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1248  Protein of unknown function DUF2207, membrane  24.23 
 
 		 652 aa  55.1  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2765  hypothetical protein  28.17 
 
 		 634 aa  50.8  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3732  hypothetical protein  21.76 
 
 		 609 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0265858  normal  0.0706106 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3926  hypothetical protein  25.69 
 
 		 360 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>