33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0145 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0145  hypothetical protein  100 
 
 
633 aa  1294    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2636  putative transmembrane signal peptide protein  29.28 
 
 
626 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0514  membrane-like protein  25.17 
 
 
639 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0577  hypothetical protein  27.24 
 
 
644 aa  170  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.464541  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0465  putative transmembrane signal peptide protein  31.63 
 
 
644 aa  167  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.559326  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0534  hypothetical protein  26.11 
 
 
644 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4521  membrane-like protein  26.7 
 
 
656 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180216  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0576  putative transmembrane signal peptide protein  24.07 
 
 
652 aa  144  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000285101  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2702  hypothetical protein  26.26 
 
 
686 aa  137  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.728623  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3740  hypothetical protein  26.33 
 
 
685 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2360  hypothetical protein  26.5 
 
 
631 aa  104  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000648065 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1377  hypothetical protein  26.5 
 
 
631 aa  104  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.469999  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1900  hypothetical protein  29.86 
 
 
527 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000762932 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1381  hypothetical protein  29.75 
 
 
661 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1493  hypothetical protein  29.75 
 
 
679 aa  99.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0707557  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1492  hypothetical protein  29.86 
 
 
631 aa  98.6  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0399  hypothetical protein  29.75 
 
 
438 aa  97.4  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719971  normal  0.0793773 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1865  hypothetical protein  34.38 
 
 
631 aa  97.1  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000596823 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2381  conserved hypothetical protein  33.75 
 
 
631 aa  94.4  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0833441  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0277  hypothetical protein  23.55 
 
 
586 aa  75.1  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2765  hypothetical protein  21.1 
 
 
634 aa  68.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0818  hypothetical protein  22.07 
 
 
543 aa  67.8  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0165146  hitchhiker  0.0000000000172103 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1259  membrane protein-like protein  24.69 
 
 
649 aa  61.2  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01254  hypothetical protein  38.81 
 
 
438 aa  54.3  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3732  hypothetical protein  20.78 
 
 
609 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0265858  normal  0.0706106 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2301  hypothetical protein  23.61 
 
 
676 aa  52  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000179124  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1248  Protein of unknown function DUF2207, membrane  19.97 
 
 
652 aa  50.8  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2422  hypothetical protein  23.48 
 
 
606 aa  47.8  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651701  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2381  hypothetical protein  23.48 
 
 
606 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2428  hypothetical protein  23.48 
 
 
606 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554313  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1926  hypothetical protein  27.21 
 
 
239 aa  47  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0384615  normal  0.526622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2685  hypothetical protein  20.26 
 
 
607 aa  44.3  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.561749  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0574  hypothetical protein  28.77 
 
 
607 aa  43.9  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19913  normal  0.950103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>