28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3926 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3926  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  691    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0661  hypothetical protein  35.53 
 
 		 573 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1248  Protein of unknown function DUF2207, membrane  34.25 
 
 		 652 aa  86.7  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2765  hypothetical protein  28.51 
 
 		 634 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0929  hypothetical protein  33.33 
 
 		 547 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0961263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0465  putative transmembrane signal peptide protein  28.64 
 
 		 644 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.559326  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2921  hypothetical protein  27.37 
 
 		 581 aa  63.2  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0484  hypothetical protein  31.69 
 
 		 498 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0480409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2301  hypothetical protein  27.88 
 
 		 676 aa  59.7  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000179124  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2702  hypothetical protein  26.21 
 
 		 686 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.728623  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3740  hypothetical protein  25.9 
 
 		 685 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1023  membrane protein-like protein  26.2 
 
 		 660 aa  55.1  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0859  hypothetical protein  30.85 
 
 		 549 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00278552  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2789  hypothetical protein  24.07 
 
 		 297 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00516287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1493  hypothetical protein  26.09 
 
 		 679 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0707557  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0399  hypothetical protein  26.09 
 
 		 438 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719971  normal  0.0793773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4521  membrane-like protein  25.29 
 
 		 656 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1381  hypothetical protein  25.69 
 
 		 661 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0534  hypothetical protein  23.08 
 
 		 644 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3732  hypothetical protein  24.69 
 
 		 609 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0265858  normal  0.0706106 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2636  putative transmembrane signal peptide protein  28.57 
 
 		 626 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0277  hypothetical protein  21.77 
 
 		 586 aa  44.7  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0514  membrane-like protein  24.21 
 
 		 639 aa  44.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0576  putative transmembrane signal peptide protein  27.94 
 
 		 652 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000285101  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4324  hypothetical protein  27.04 
 
 		 613 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1900  hypothetical protein  24.85 
 
 		 527 aa  43.5  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762932 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0577  hypothetical protein  23.79 
 
 		 644 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.464541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1865  hypothetical protein  24.85 
 
 		 631 aa  43.1  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000596823 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>