33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0577 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0534  hypothetical protein  90.55 
 
 		 644 aa  1075    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0577  hypothetical protein  100 
 
 		 644 aa  1293    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.464541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0465  putative transmembrane signal peptide protein  56.63 
 
 		 644 aa  636    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.559326  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2636  putative transmembrane signal peptide protein  34.33 
 
 		 626 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0514  membrane-like protein  35.44 
 
 		 639 aa  316  7e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4521  membrane-like protein  33.61 
 
 		 656 aa  289  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0576  putative transmembrane signal peptide protein  30.16 
 
 		 652 aa  203  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000285101  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0145  hypothetical protein  26.79 
 
 		 633 aa  180  5.999999999999999e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2702  hypothetical protein  28.11 
 
 		 686 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.728623  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3740  hypothetical protein  26.28 
 
 		 685 aa  171  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1381  hypothetical protein  24.33 
 
 		 661 aa  141  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1493  hypothetical protein  24.33 
 
 		 679 aa  140  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0707557  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0399  hypothetical protein  34.63 
 
 		 438 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719971  normal  0.0793773 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2360  hypothetical protein  26.96 
 
 		 631 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000648065 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1377  hypothetical protein  26.96 
 
 		 631 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.469999  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0818  hypothetical protein  26.01 
 
 		 543 aa  116  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0165146  hitchhiker  0.0000000000172103 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1492  hypothetical protein  26.72 
 
 		 631 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1865  hypothetical protein  26.72 
 
 		 631 aa  108  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000596823 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2381  conserved hypothetical protein  26.47 
 
 		 631 aa  106  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0833441  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1900  hypothetical protein  34.12 
 
 		 527 aa  105  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762932 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0574  hypothetical protein  23.78 
 
 		 607 aa  90.9  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19913  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2765  hypothetical protein  23.52 
 
 		 634 aa  68.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1248  Protein of unknown function DUF2207, membrane  22.44 
 
 		 652 aa  67.8  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0277  hypothetical protein  26.64 
 
 		 586 aa  65.1  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2422  hypothetical protein  23.19 
 
 		 606 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2428  hypothetical protein  23.19 
 
 		 606 aa  62  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554313  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2381  hypothetical protein  23.19 
 
 		 606 aa  62  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01254  hypothetical protein  25.08 
 
 		 438 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0530  hypothetical protein  23.94 
 
 		 348 aa  53.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252923  normal  0.408667 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1023  membrane protein-like protein  23.76 
 
 		 660 aa  52.4  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3926  hypothetical protein  23.95 
 
 		 360 aa  47.4  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0531  hypothetical protein  26.92 
 
 		 202 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1259  membrane protein-like protein  21.01 
 
 		 649 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>