25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2428 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2381  hypothetical protein  100 
 
 
606 aa  1215    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2428  hypothetical protein  100 
 
 
606 aa  1215    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554313  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2685  hypothetical protein  62.43 
 
 
607 aa  695    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.561749  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2422  hypothetical protein  99.83 
 
 
606 aa  1214    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651701  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3732  hypothetical protein  62.13 
 
 
609 aa  686    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0265858  normal  0.0706106 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2765  hypothetical protein  23.5 
 
 
634 aa  68.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4521  membrane-like protein  32.7 
 
 
656 aa  63.9  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180216  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0577  hypothetical protein  27.13 
 
 
644 aa  57.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.464541  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0534  hypothetical protein  27.08 
 
 
644 aa  57.4  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2636  putative transmembrane signal peptide protein  20.86 
 
 
626 aa  57  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0145  hypothetical protein  22.89 
 
 
633 aa  55.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0465  putative transmembrane signal peptide protein  27.74 
 
 
644 aa  55.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.559326  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3740  hypothetical protein  24.08 
 
 
685 aa  53.9  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1248  Protein of unknown function DUF2207, membrane  23.83 
 
 
652 aa  52.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0576  putative transmembrane signal peptide protein  28.21 
 
 
652 aa  51.6  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000285101  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1865  hypothetical protein  25.73 
 
 
631 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000596823 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2702  hypothetical protein  23.21 
 
 
686 aa  50.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.728623  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0661  hypothetical protein  23.6 
 
 
573 aa  49.3  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2360  hypothetical protein  23.5 
 
 
631 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000648065 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1377  hypothetical protein  23.5 
 
 
631 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.469999  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0929  hypothetical protein  22.35 
 
 
547 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0961263  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1900  hypothetical protein  24.9 
 
 
527 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000762932 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1492  hypothetical protein  26.07 
 
 
631 aa  47.4  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2381  conserved hypothetical protein  23.75 
 
 
631 aa  44.7  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0833441  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0514  membrane-like protein  29.75 
 
 
639 aa  44.7  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>