23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1259 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1259  membrane protein-like protein  100 
 
 
649 aa  1300    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0484  hypothetical protein  28.38 
 
 
498 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0480409  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2765  hypothetical protein  27.49 
 
 
634 aa  132  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0661  hypothetical protein  28.22 
 
 
573 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1248  Protein of unknown function DUF2207, membrane  30.04 
 
 
652 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1844  membrane protein-like protein  23.57 
 
 
598 aa  112  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.478995  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0929  hypothetical protein  26.88 
 
 
547 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0961263  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2921  hypothetical protein  27.78 
 
 
581 aa  99.4  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2789  hypothetical protein  27.2 
 
 
297 aa  83.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00516287  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4324  hypothetical protein  24.91 
 
 
613 aa  77.8  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0361  hypothetical protein  24.48 
 
 
607 aa  77.8  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0514  membrane-like protein  22.7 
 
 
639 aa  74.3  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27530  predicted membrane protein  22.11 
 
 
669 aa  68.2  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00352231  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1466  hypothetical protein  25.71 
 
 
465 aa  59.7  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0145  hypothetical protein  25 
 
 
633 aa  59.3  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0093  membrane protein-like protein  21.5 
 
 
667 aa  57.8  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0465  putative transmembrane signal peptide protein  21.45 
 
 
644 aa  50.8  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.559326  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0859  hypothetical protein  24.51 
 
 
549 aa  48.9  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00278552  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12710  predicted membrane protein  20.09 
 
 
662 aa  47.8  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.942677  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2636  putative transmembrane signal peptide protein  22.83 
 
 
626 aa  47.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1067  hypothetical protein  24.57 
 
 
756 aa  47  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0577  hypothetical protein  22.36 
 
 
644 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.464541  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2259  membrane protein  22.7 
 
 
632 aa  45.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.158397  hitchhiker  0.00085756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>