33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2636 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2636  putative transmembrane signal peptide protein  100 
 
 		 626 aa  1269    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0514  membrane-like protein  42.18 
 
 		 639 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0534  hypothetical protein  34.18 
 
 		 644 aa  323  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0577  hypothetical protein  34.37 
 
 		 644 aa  319  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.464541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0465  putative transmembrane signal peptide protein  32.1 
 
 		 644 aa  312  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.559326  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4521  membrane-like protein  35.46 
 
 		 656 aa  307  5.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2702  hypothetical protein  29.83 
 
 		 686 aa  231  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.728623  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3740  hypothetical protein  29.19 
 
 		 685 aa  231  4e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0145  hypothetical protein  28.41 
 
 		 633 aa  216  9.999999999999999e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0576  putative transmembrane signal peptide protein  30.02 
 
 		 652 aa  196  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000285101  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1493  hypothetical protein  26.75 
 
 		 679 aa  172  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0707557  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1381  hypothetical protein  26.75 
 
 		 661 aa  172  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0399  hypothetical protein  27.2 
 
 		 438 aa  144  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719971  normal  0.0793773 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1377  hypothetical protein  23.65 
 
 		 631 aa  128  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.469999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2360  hypothetical protein  23.65 
 
 		 631 aa  127  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000648065 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1865  hypothetical protein  23.83 
 
 		 631 aa  124  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000596823 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1492  hypothetical protein  22.94 
 
 		 631 aa  124  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2381  conserved hypothetical protein  22.58 
 
 		 631 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0833441  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0818  hypothetical protein  24.37 
 
 		 543 aa  94.7  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0165146  hitchhiker  0.0000000000172103 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1900  hypothetical protein  28.75 
 
 		 527 aa  92  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762932 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2765  hypothetical protein  24.8 
 
 		 634 aa  91.3  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1248  Protein of unknown function DUF2207, membrane  24.95 
 
 		 652 aa  76.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0574  hypothetical protein  23.49 
 
 		 607 aa  62  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19913  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01254  hypothetical protein  20.24 
 
 		 438 aa  62  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0277  hypothetical protein  26.05 
 
 		 586 aa  57.8  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0929  hypothetical protein  24.25 
 
 		 547 aa  57.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0961263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1926  hypothetical protein  32.11 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0384615  normal  0.526622 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0484  hypothetical protein  25.06 
 
 		 498 aa  55.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0480409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0661  hypothetical protein  22.43 
 
 		 573 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2422  hypothetical protein  23.38 
 
 		 606 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2428  hypothetical protein  23.38 
 
 		 606 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554313  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2381  hypothetical protein  23.38 
 
 		 606 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1259  membrane protein-like protein  22.83 
 
 		 649 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>