22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0929 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0484  hypothetical protein  69.57 
 
 
498 aa  683    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0480409  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0929  hypothetical protein  100 
 
 
547 aa  1094    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0961263  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0661  hypothetical protein  54.48 
 
 
573 aa  525  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2921  hypothetical protein  46.46 
 
 
581 aa  426  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4324  hypothetical protein  43.11 
 
 
613 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2765  hypothetical protein  35.96 
 
 
634 aa  246  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0859  hypothetical protein  38.3 
 
 
549 aa  237  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00278552  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1248  Protein of unknown function DUF2207, membrane  33.87 
 
 
652 aa  223  8e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1259  membrane protein-like protein  26.88 
 
 
649 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1466  hypothetical protein  27.31 
 
 
465 aa  111  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3926  hypothetical protein  32.63 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2636  putative transmembrane signal peptide protein  24.87 
 
 
626 aa  67.8  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2381  hypothetical protein  22.59 
 
 
606 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2428  hypothetical protein  22.59 
 
 
606 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554313  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2422  hypothetical protein  22.59 
 
 
606 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651701  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3740  hypothetical protein  23.95 
 
 
685 aa  57  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0514  membrane-like protein  28.21 
 
 
639 aa  55.1  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4521  membrane-like protein  33.64 
 
 
656 aa  53.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180216  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0093  membrane protein-like protein  26.14 
 
 
667 aa  51.2  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0464  hypothetical protein  30.91 
 
 
566 aa  49.3  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0145  hypothetical protein  21.41 
 
 
633 aa  48.9  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2702  hypothetical protein  23.47 
 
 
686 aa  47.4  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.728623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>