17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0484 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0484  hypothetical protein  100 
 
 
498 aa  999    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0480409  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0929  hypothetical protein  69.57 
 
 
547 aa  683    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0961263  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0661  hypothetical protein  54.1 
 
 
573 aa  482  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2921  hypothetical protein  45.09 
 
 
581 aa  404  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4324  hypothetical protein  41.82 
 
 
613 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0859  hypothetical protein  38.8 
 
 
549 aa  239  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00278552  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2765  hypothetical protein  37.19 
 
 
634 aa  236  7e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1248  Protein of unknown function DUF2207, membrane  34.93 
 
 
652 aa  222  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1259  membrane protein-like protein  28.83 
 
 
649 aa  145  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1466  hypothetical protein  30.63 
 
 
465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3926  hypothetical protein  31.69 
 
 
360 aa  63.9  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2636  putative transmembrane signal peptide protein  25.06 
 
 
626 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0093  membrane protein-like protein  23.75 
 
 
667 aa  51.6  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4521  membrane-like protein  32.73 
 
 
656 aa  51.6  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180216  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0514  membrane-like protein  28.73 
 
 
639 aa  50.4  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0464  hypothetical protein  27.86 
 
 
566 aa  46.6  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0735  hypothetical protein  25.35 
 
 
598 aa  45.1  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0169011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>