17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0735 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0735  hypothetical protein  100 
 
 
598 aa  1220    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0169011 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0433  hypothetical protein  24.01 
 
 
613 aa  172  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.398189  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1023  membrane protein-like protein  24.92 
 
 
660 aa  136  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27530  predicted membrane protein  23.1 
 
 
669 aa  108  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00352231  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12710  predicted membrane protein  22.98 
 
 
662 aa  107  8e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.942677  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0093  membrane protein-like protein  23.37 
 
 
667 aa  105  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1844  membrane protein-like protein  23.86 
 
 
598 aa  97.1  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.478995  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0361  hypothetical protein  22.2 
 
 
607 aa  94.7  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0137  hypothetical protein  26.18 
 
 
627 aa  61.6  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1065  hypothetical protein  27.44 
 
 
604 aa  61.6  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0721  membrane protein-like protein  21.49 
 
 
573 aa  60.8  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0484  hypothetical protein  25.35 
 
 
498 aa  55.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0480409  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1067  hypothetical protein  25 
 
 
756 aa  54.7  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2765  hypothetical protein  23.85 
 
 
634 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1259  membrane protein-like protein  21.43 
 
 
649 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2842  hypothetical protein  20.55 
 
 
675 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00272449  normal  0.0507641 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2431  ribosomal protein S14  29.51 
 
 
561 aa  43.9  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>