22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0661 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0661  hypothetical protein  100 
 
 
573 aa  1140    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0929  hypothetical protein  54.85 
 
 
547 aa  527  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0961263  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0484  hypothetical protein  54.1 
 
 
498 aa  485  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0480409  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2921  hypothetical protein  43.28 
 
 
581 aa  404  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4324  hypothetical protein  40.14 
 
 
613 aa  349  9e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1248  Protein of unknown function DUF2207, membrane  35.28 
 
 
652 aa  264  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2765  hypothetical protein  35.5 
 
 
634 aa  264  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0859  hypothetical protein  37.39 
 
 
549 aa  236  9e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00278552  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1259  membrane protein-like protein  27.74 
 
 
649 aa  136  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1466  hypothetical protein  31.13 
 
 
465 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3926  hypothetical protein  35.53 
 
 
360 aa  88.2  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2636  putative transmembrane signal peptide protein  23.04 
 
 
626 aa  60.5  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2381  hypothetical protein  24.32 
 
 
606 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2428  hypothetical protein  24.32 
 
 
606 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554313  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2422  hypothetical protein  24.32 
 
 
606 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651701  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3740  hypothetical protein  23.74 
 
 
685 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0514  membrane-like protein  25.08 
 
 
639 aa  50.8  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0464  hypothetical protein  22.47 
 
 
566 aa  50.4  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4521  membrane-like protein  28.18 
 
 
656 aa  44.3  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180216  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1377  hypothetical protein  22.42 
 
 
631 aa  43.9  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.469999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2360  hypothetical protein  22.42 
 
 
631 aa  43.9  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000648065 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2702  hypothetical protein  23.86 
 
 
686 aa  43.5  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.728623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>