31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2702 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2702  hypothetical protein  100 
 
 
686 aa  1407    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.728623  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3740  hypothetical protein  78.37 
 
 
685 aa  1038    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1493  hypothetical protein  49.22 
 
 
679 aa  558  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0707557  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1381  hypothetical protein  50.74 
 
 
661 aa  554  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0399  hypothetical protein  49.67 
 
 
438 aa  410  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719971  normal  0.0793773 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2636  putative transmembrane signal peptide protein  30.17 
 
 
626 aa  230  7e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2360  hypothetical protein  27.6 
 
 
631 aa  211  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000648065 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1377  hypothetical protein  27.43 
 
 
631 aa  207  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.469999  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1492  hypothetical protein  28.12 
 
 
631 aa  205  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1865  hypothetical protein  27.81 
 
 
631 aa  200  9e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000596823 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2381  conserved hypothetical protein  27.95 
 
 
631 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0833441  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0514  membrane-like protein  27.47 
 
 
639 aa  189  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4521  membrane-like protein  27.41 
 
 
656 aa  184  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180216  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0577  hypothetical protein  27.94 
 
 
644 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.464541  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0534  hypothetical protein  28.14 
 
 
644 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1900  hypothetical protein  36.84 
 
 
527 aa  171  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000762932 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0465  putative transmembrane signal peptide protein  26.64 
 
 
644 aa  165  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.559326  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1926  hypothetical protein  48.24 
 
 
239 aa  162  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0384615  normal  0.526622 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0145  hypothetical protein  26.19 
 
 
633 aa  143  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0576  putative transmembrane signal peptide protein  25.9 
 
 
652 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000285101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01254  hypothetical protein  26.7 
 
 
438 aa  128  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3732  hypothetical protein  25.83 
 
 
609 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0265858  normal  0.0706106 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0818  hypothetical protein  23.43 
 
 
543 aa  53.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0165146  hitchhiker  0.0000000000172103 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0277  hypothetical protein  26.47 
 
 
586 aa  53.1  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2422  hypothetical protein  22.75 
 
 
606 aa  51.6  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651701  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2428  hypothetical protein  22.75 
 
 
606 aa  51.6  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554313  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2381  hypothetical protein  22.75 
 
 
606 aa  51.6  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3926  hypothetical protein  25.35 
 
 
360 aa  50.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2765  hypothetical protein  20.42 
 
 
634 aa  49.3  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2301  hypothetical protein  21.9 
 
 
676 aa  47.8  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000179124  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1248  Protein of unknown function DUF2207, membrane  24.83 
 
 
652 aa  44.3  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>