23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0277 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0277  hypothetical protein  100 
 
 		 586 aa  1163    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0145  hypothetical protein  24.26 
 
 		 633 aa  82.4  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0465  putative transmembrane signal peptide protein  30.51 
 
 		 644 aa  74.3  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.559326  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2301  hypothetical protein  27.8 
 
 		 676 aa  68.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000179124  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0514  membrane-like protein  28.57 
 
 		 639 aa  67.8  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1381  hypothetical protein  27.88 
 
 		 661 aa  63.9  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1493  hypothetical protein  27.88 
 
 		 679 aa  63.9  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0707557  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4521  membrane-like protein  27.12 
 
 		 656 aa  63.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0399  hypothetical protein  27.88 
 
 		 438 aa  63.2  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719971  normal  0.0793773 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0577  hypothetical protein  25.93 
 
 		 644 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.464541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0534  hypothetical protein  28.24 
 
 		 644 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2636  putative transmembrane signal peptide protein  26.05 
 
 		 626 aa  60.1  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1865  hypothetical protein  27.53 
 
 		 631 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000596823 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2360  hypothetical protein  26.44 
 
 		 631 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000648065 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1377  hypothetical protein  26.44 
 
 		 631 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.469999  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1900  hypothetical protein  26.97 
 
 		 527 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762932 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2381  conserved hypothetical protein  26.97 
 
 		 631 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0833441  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1492  hypothetical protein  26.97 
 
 		 631 aa  57.8  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2702  hypothetical protein  26.47 
 
 		 686 aa  54.3  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.728623  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3740  hypothetical protein  26.83 
 
 		 685 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2765  hypothetical protein  18.54 
 
 		 634 aa  53.5  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3926  hypothetical protein  21.77 
 
 		 360 aa  45.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0576  putative transmembrane signal peptide protein  24.7 
 
 		 652 aa  44.3  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000285101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>