25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1865 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2381  conserved hypothetical protein  95.12 
 
 		 631 aa  1185    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0833441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01254  hypothetical protein  96.35 
 
 		 438 aa  848    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1377  hypothetical protein  94.8 
 
 		 631 aa  1211    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.469999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2360  hypothetical protein  94.96 
 
 		 631 aa  1214    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000648065 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1865  hypothetical protein  100 
 
 		 631 aa  1299    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000596823 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1492  hypothetical protein  95.45 
 
 		 631 aa  1190    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1900  hypothetical protein  96.42 
 
 		 527 aa  545  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762932 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2702  hypothetical protein  27.77 
 
 		 686 aa  209  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.728623  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3740  hypothetical protein  28.62 
 
 		 685 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1381  hypothetical protein  28.12 
 
 		 661 aa  192  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1493  hypothetical protein  28.3 
 
 		 679 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0707557  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0399  hypothetical protein  30.71 
 
 		 438 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719971  normal  0.0793773 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2636  putative transmembrane signal peptide protein  23.83 
 
 		 626 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0514  membrane-like protein  26.29 
 
 		 639 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0577  hypothetical protein  26.47 
 
 		 644 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.464541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0534  hypothetical protein  27.96 
 
 		 644 aa  107  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0465  putative transmembrane signal peptide protein  27.61 
 
 		 644 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.559326  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0145  hypothetical protein  28.74 
 
 		 633 aa  100  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4521  membrane-like protein  26.17 
 
 		 656 aa  96.3  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0576  putative transmembrane signal peptide protein  25.06 
 
 		 652 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000285101  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0277  hypothetical protein  27.53 
 
 		 586 aa  58.2  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2301  hypothetical protein  26.86 
 
 		 676 aa  52.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000179124  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2422  hypothetical protein  24.32 
 
 		 606 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2428  hypothetical protein  24.32 
 
 		 606 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554313  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2381  hypothetical protein  24.32 
 
 		 606 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>