18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12710 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_12710  predicted membrane protein  100 
 
 		 662 aa  1364    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.942677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0093  membrane protein-like protein  45.42 
 
 		 667 aa  547  1e-154  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27530  predicted membrane protein  36.09 
 
 		 669 aa  423  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00352231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1023  membrane protein-like protein  31.47 
 
 		 660 aa  283  1e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1844  membrane protein-like protein  22.65 
 
 		 598 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.478995  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0361  hypothetical protein  24.05 
 
 		 607 aa  126  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0735  hypothetical protein  23.1 
 
 		 598 aa  108  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0169011 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2259  membrane protein  22.64 
 
 		 632 aa  77.4  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.158397  hitchhiker  0.00085756 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1067  hypothetical protein  21.79 
 
 		 756 aa  75.5  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0721  membrane protein-like protein  22.2 
 
 		 573 aa  72  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0119  hypothetical protein  24.24 
 
 		 567 aa  64.7  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00804511  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2431  ribosomal protein S14  21.28 
 
 		 561 aa  63.9  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0433  hypothetical protein  18.37 
 
 		 613 aa  61.2  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.398189  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1259  membrane protein-like protein  21.28 
 
 		 649 aa  56.2  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1065  hypothetical protein  26.62 
 
 		 604 aa  50.1  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2636  putative transmembrane signal peptide protein  23.44 
 
 		 626 aa  46.2  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2842  hypothetical protein  28.33 
 
 		 675 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00272449  normal  0.0507641 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3740  hypothetical protein  20.65 
 
 		 685 aa  44.7  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>