16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1023 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1023  membrane protein-like protein  100 
 
 		 660 aa  1357    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0093  membrane protein-like protein  33.54 
 
 		 667 aa  294  4e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12710  predicted membrane protein  31.47 
 
 		 662 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.942677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27530  predicted membrane protein  30.87 
 
 		 669 aa  269  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00352231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0735  hypothetical protein  24.07 
 
 		 598 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0169011 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1844  membrane protein-like protein  23.7 
 
 		 598 aa  117  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.478995  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0721  membrane protein-like protein  22.16 
 
 		 573 aa  86.3  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0361  hypothetical protein  20.98 
 
 		 607 aa  82  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0433  hypothetical protein  23.22 
 
 		 613 aa  75.9  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.398189  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1065  hypothetical protein  22.01 
 
 		 604 aa  73.6  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2842  hypothetical protein  21.71 
 
 		 675 aa  72  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00272449  normal  0.0507641 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1067  hypothetical protein  20.7 
 
 		 756 aa  60.1  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3926  hypothetical protein  26.32 
 
 		 360 aa  52.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0577  hypothetical protein  23.08 
 
 		 644 aa  47.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.464541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2431  ribosomal protein S14  23.22 
 
 		 561 aa  47  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2259  membrane protein  20 
 
 		 632 aa  47  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.158397  hitchhiker  0.00085756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>