12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0433 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0433  hypothetical protein  100 
 
 		 613 aa  1250    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.398189  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0735  hypothetical protein  23.84 
 
 		 598 aa  165  3e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0169011 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0137  hypothetical protein  24.96 
 
 		 627 aa  104  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1023  membrane protein-like protein  22.59 
 
 		 660 aa  69.3  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0361  hypothetical protein  21.57 
 
 		 607 aa  63.5  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12710  predicted membrane protein  18.2 
 
 		 662 aa  55.1  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.942677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0093  membrane protein-like protein  19.76 
 
 		 667 aa  50.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0789  hypothetical protein  25.93 
 
 		 616 aa  48.5  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.685976  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0721  membrane protein-like protein  19.53 
 
 		 573 aa  45.8  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2464  hypothetical protein  28.4 
 
 		 608 aa  45.4  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27530  predicted membrane protein  20.23 
 
 		 669 aa  45.4  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00352231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2431  ribosomal protein S14  37.5 
 
 		 561 aa  43.9  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>