94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6006 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6006  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 		 163 aa  330  6e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.768135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5761  flavodoxin/nitric oxide synthase  98.77 
 
 		 163 aa  329  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.643418  normal  0.673071 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7733  oxidoreductase  94.63 
 
 		 163 aa  290  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6187  flavodoxin/nitric oxide synthase  95.09 
 
 		 163 aa  279  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5822  flavodoxin/nitric oxide synthase  95.09 
 
 		 163 aa  279  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6666  flavodoxin/nitric oxide synthase  94.48 
 
 		 163 aa  277  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6157  flavodoxin/nitric oxide synthase  87.73 
 
 		 193 aa  265  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295986  normal  0.101429 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3490  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  88.34 
 
 		 163 aa  253  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572882  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4330  flavodoxin/nitric oxide synthase  75.31 
 
 		 165 aa  234  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  0.0216763 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4220  flavodoxin/nitric oxide synthase  75.31 
 
 		 165 aa  234  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  71.17 
 
 		 166 aa  224  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2016  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  72.22 
 
 		 166 aa  224  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3330  flavodoxin/nitric oxide synthase  68.71 
 
 		 194 aa  213  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252914 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2493  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  67.72 
 
 		 174 aa  195  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000345605 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2762  hypothetical protein  57.32 
 
 		 161 aa  185  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.929868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2272  hypothetical protein  55.9 
 
 		 162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0129429  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3017  multimeric flavodoxin WrbA  59.31 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  43.83 
 
 		 154 aa  122  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2324  hypothetical protein  42.17 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05610  hypothetical protein  39.75 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0557  hypothetical protein  39.02 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1398  hypothetical protein  37.72 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792672  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2896  hypothetical protein  39.02 
 
 		 151 aa  102  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0567  hypothetical protein  39.02 
 
 		 154 aa  100  7e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.765091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1931  hypothetical protein  40.96 
 
 		 150 aa  97.8  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2109  hypothetical protein  42.86 
 
 		 150 aa  97.4  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2155  hypothetical protein  42.86 
 
 		 150 aa  97.4  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2174  multimeric flavodoxin WrbA  38.75 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0648  hypothetical protein  42.33 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0321  hypothetical protein  41.6 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3354  multimeric flavodoxin WrbA  42.4 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0792608  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2081  multimeric flavodoxin WrbA  37.58 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5173  hypothetical protein  38.89 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1429  hypothetical protein  30.3 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12784  hypothetical protein  35.19 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1758  hypothetical protein  33.13 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4011  hypothetical protein  35.85 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  decreased coverage  0.00529167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2376  hypothetical protein  34.59 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.444871  normal  0.0454888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2093  NADPH-dependent FMN reductase  36.28 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2300  hypothetical protein  38.14 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20060  hypothetical protein  29.55 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00380  TrpR binding protein WrbA  33.68 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  31.58 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  31.58 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  36 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  33.68 
 
 		 203 aa  52.4  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  28.42 
 
 		 200 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  27.84 
 
 		 204 aa  47.4  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  32.98 
 
 		 203 aa  47.4  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  28.42 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  27.37 
 
 		 200 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  30.43 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1813  TrpR binding protein WrbA  28.42 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000250234  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  27.84 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  36 
 
 		 195 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  27.37 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0482  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.39 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000255007  decreased coverage  0.000283878 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1194  TrpR binding protein WrbA  27.66 
 
 		 198 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1078  TrpR binding protein WrbA  27.66 
 
 		 198 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1183  TrpR binding protein WrbA  27.66 
 
 		 198 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1229  TrpR binding protein WrbA  27.66 
 
 		 198 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.570385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1214  TrpR binding protein WrbA  27.66 
 
 		 198 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.332262 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2261  TrpR binding protein WrbA  28.42 
 
 		 199 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.999788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2363  TrpR binding protein WrbA  28.42 
 
 		 199 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00380027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2043  TrpR binding protein WrbA  28.42 
 
 		 199 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0806093  normal  0.0679166 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0330  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.87 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  26.32 
 
 		 200 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1414  hypothetical protein  28.81 
 
 		 145 aa  45.1  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201843  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  26.32 
 
 		 200 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  26.32 
 
 		 200 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  31.91 
 
 		 203 aa  44.3  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  35.37 
 
 		 213 aa  44.3  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1516  TrpR binding protein WrbA  30.85 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3178  flavoprotein WrbA  35.11 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  28.42 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3134  TrpR binding protein WrbA  26.05 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  29.79 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  24.21 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2222  flavoprotein WrbA  28.26 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  28.42 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2331  hypothetical protein  31.87 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.72 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2895  hypothetical protein  32.98 
 
 		 82 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2234  flavoprotein WrbA  29.35 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  26.32 
 
 		 200 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  27.66 
 
 		 199 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0608  TrpR binding protein WrbA  30.53 
 
 		 198 aa  42  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 		 188 aa  42  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1242  TrpR binding protein WrbA  26.6 
 
 		 198 aa  41.2  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2648  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.03 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000348313  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1251  flavoprotein WrbA  31.58 
 
 		 206 aa  40.8  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  29.47 
 
 		 199 aa  40.4  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  29.47 
 
 		 199 aa  40.4  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>