164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3475 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1480  EvpB family type VI secretion protein  77.8 
 
 		 500 aa  850    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3908  EvpB family type VI secretion protein  93.36 
 
 		 497 aa  980    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.38023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3564  EvpB family type VI secretion protein  59.51 
 
 		 503 aa  648    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0404  hypothetical protein  72.01 
 
 		 502 aa  776    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1910  hypothetical protein  85.77 
 
 		 499 aa  916    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1682  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  84.74 
 
 		 497 aa  876    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.509952  normal  0.0159997 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0297  SciI protein  82.04 
 
 		 502 aa  843    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.770201 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1199  hypothetical protein  72.01 
 
 		 502 aa  776    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1606  hypothetical protein  84.44 
 
 		 499 aa  898    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128756  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1694  hypothetical protein  85.77 
 
 		 530 aa  915    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00265  SciI protein  68.48 
 
 		 500 aa  713    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0981  hypothetical protein  92.96 
 
 		 497 aa  981    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1587  hypothetical protein  71.26 
 
 		 502 aa  770    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261509  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0122  hypothetical protein  84.65 
 
 		 499 aa  899    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0259  hypothetical protein  73.67 
 
 		 502 aa  783    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2460  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  75.47 
 
 		 499 aa  802    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0762  hypothetical protein  59.51 
 
 		 500 aa  649    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.277703  normal  0.125026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0194  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  73.33 
 
 		 502 aa  779    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2094  putative cytoplasmic protein  90.48 
 
 		 497 aa  932    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2872  hypothetical protein  77.8 
 
 		 500 aa  850    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3004  hypothetical protein  73.66 
 
 		 501 aa  803    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3475  hypothetical protein  100 
 
 		 497 aa  1042    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217295  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01020  hypothetical protein  73.27 
 
 		 498 aa  761    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0300  EvpB family type VI secretion protein  81.43 
 
 		 502 aa  842    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205878  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3851  EvpB family type VI secretion protein  76.75 
 
 		 497 aa  828    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4090  EvpB family type VI secretion protein  75.16 
 
 		 498 aa  784    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000002005 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6113  EvpB family type VI secretion protein  90.34 
 
 		 497 aa  951    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.32673 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1477  hypothetical protein  78.19 
 
 		 499 aa  823    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.640314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0549  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  72.59 
 
 		 497 aa  731    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0922  hypothetical protein  85.77 
 
 		 499 aa  916    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1601  hypothetical protein  72.01 
 
 		 502 aa  776    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0940  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  88.98 
 
 		 499 aa  897    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1209  hypothetical protein  85.77 
 
 		 499 aa  916    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1784  hypothetical protein  72.01 
 
 		 502 aa  776    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0158  hypothetical protein  84.44 
 
 		 499 aa  898    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0333  hypothetical protein  86.17 
 
 		 499 aa  919    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2959  hypothetical protein  72.01 
 
 		 502 aa  776    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0134  hypothetical protein  84.44 
 
 		 499 aa  898    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.831371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0242  hypothetical protein  85.97 
 
 		 499 aa  917    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2834  hypothetical protein  72.01 
 
 		 502 aa  776    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0454  hypothetical protein  72.01 
 
 		 502 aa  776    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2184  hypothetical protein  85.77 
 
 		 499 aa  916    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26660  hypothetical protein  73.64 
 
 		 500 aa  772    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2323  hypothetical protein  73.39 
 
 		 498 aa  786    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0970803  normal  0.0167765 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0306  type VI secretion protein, EvpB/family  81.43 
 
 		 502 aa  842    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0156  hypothetical protein  73.27 
 
 		 498 aa  761    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6674  EvpB family type VI secretion protein  82.63 
 
 		 499 aa  866    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.585519  normal  0.849864 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1368  hypothetical protein  77.8 
 
 		 500 aa  850    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0312  type VI secretion protein, EvpB/family  81.43 
 
 		 502 aa  842    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3435  hypothetical protein  59.51 
 
 		 500 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333697  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3027  EvpB family type VI secretion protein  83.64 
 
 		 499 aa  871    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0439  hypothetical protein  59.88 
 
 		 503 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.395264  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1900  hypothetical protein  59.75 
 
 		 501 aa  628  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3040  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  60.71 
 
 		 506 aa  629  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2075  hypothetical protein  59.88 
 
 		 501 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0748  hypothetical protein  59.88 
 
 		 501 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1043  hypothetical protein  59.88 
 
 		 501 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0790  hypothetical protein  59.88 
 
 		 501 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0701  hypothetical protein  59.88 
 
 		 501 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2017  hypothetical protein  59.88 
 
 		 501 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2361  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  58.21 
 
 		 504 aa  599  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0877171 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2444  hypothetical protein  54.17 
 
 		 504 aa  551  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3122  hypothetical protein  55.8 
 
 		 503 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.048551  normal  0.0269091 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3478  hypothetical protein  55.4 
 
 		 505 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.384738  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2368  hypothetical protein  50.74 
 
 		 497 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3072  hypothetical protein  51.42 
 
 		 497 aa  486  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02046  EvpB  48.63 
 
 		 498 aa  476  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422176  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1530  hypothetical protein  46.76 
 
 		 491 aa  472  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.704852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2269  hypothetical protein  50.89 
 
 		 499 aa  472  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256541  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3042  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  49.19 
 
 		 495 aa  472  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000021  uncharacterized protein ImpC  49.15 
 
 		 497 aa  473  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.147425  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2176  hypothetical protein  48.11 
 
 		 494 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000122545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1208  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  48.59 
 
 		 495 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1732  hypothetical protein  50.33 
 
 		 500 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.473606  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2509  EvpB family type VI secretion protein  51.73 
 
 		 500 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0777489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6050  hypothetical protein  48.35 
 
 		 493 aa  465  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2765  EvpB family type VI secretion protein  50.63 
 
 		 500 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0505652  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3099  hypothetical protein  50.42 
 
 		 500 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01964  hypothetical protein  47.46 
 
 		 496 aa  461  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470165  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4954  hypothetical protein  52.67 
 
 		 500 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2623  hypothetical protein  50.42 
 
 		 500 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2929  EvpB family type VI secretion protein  47.37 
 
 		 496 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0212184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3643  hypothetical protein  47.46 
 
 		 496 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.012047  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3560  hypothetical protein  47.88 
 
 		 496 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00109925  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2963  hypothetical protein  47.2 
 
 		 496 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3026  hypothetical protein  46.84 
 
 		 494 aa  458  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00788252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2638  hypothetical protein  47.88 
 
 		 496 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000879955  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0382  hypothetical protein  47.67 
 
 		 496 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0468  hypothetical protein  47.88 
 
 		 496 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000282714  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3634  hypothetical protein  47.46 
 
 		 496 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0294891  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3659  hypothetical protein  47.46 
 
 		 496 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233212  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0446  EvpB family type VI secretion protein  47.88 
 
 		 496 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0234232  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0403  EvpB family type VI secretion protein  47.67 
 
 		 496 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000570497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5979  EvpB family type VI secretion protein  49.01 
 
 		 502 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4914  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  46.4 
 
 		 496 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000326238  normal  0.0140639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3407  hypothetical protein  48.99 
 
 		 494 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34050  hypothetical protein  50.56 
 
 		 494 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27646  normal  0.0910485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2895  hypothetical protein  50.56 
 
 		 494 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50810  DUF877 family protein  48.78 
 
 		 493 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0624  hypothetical protein  45.67 
 
 		 525 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0350498 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>