More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5216 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3393  ABC transporter related  89.11 
 
 		 391 aa  650    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0311  ABC metal ion transporter, ATPase subunit  91.21 
 
 		 398 aa  669    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4931  ABC transporter related  90.4 
 
 		 392 aa  668    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247063  normal  0.893842 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3029  ABC transporter related  90.91 
 
 		 394 aa  677    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193089  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4687  ABC transporter related  97.7 
 
 		 391 aa  743    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00669309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5337  ABC transporter related  90.91 
 
 		 394 aa  677    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5216  ABC transporter related  100 
 
 		 391 aa  763    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329969 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0546  methionine ABC transporter ATP-binding protein  78.45 
 
 		 405 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0448  methionine ABC transporter ATP-binding protein  78.12 
 
 		 404 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0858  methionine ABC transporter ATP-binding protein  78.12 
 
 		 404 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2174  methionine ABC transporter ATP-binding protein  78.12 
 
 		 404 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1439  ABC transporter, ATP-binding protein  83.59 
 
 		 361 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1867  ABC transporter, ATP-binding protein  83.44 
 
 		 380 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0621935  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0853  ABC methionine transporter, ATPase subunit  69.83 
 
 		 386 aa  510  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00389788  hitchhiker  0.00726443 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4539  ABC transporter related  69.4 
 
 		 386 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0236  ABC transporter-like  60.91 
 
 		 374 aa  418  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31520  ABC transporter, ATP-binding component  61.27 
 
 		 385 aa  401  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5188  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  59.49 
 
 		 343 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0350  ABC transporter  59.15 
 
 		 376 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100794  normal  0.782008 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2365  ABC transporter related  60.33 
 
 		 365 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0817479  hitchhiker  0.00312127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34270  putative ATP-binding component of ABC transporter  58.95 
 
 		 369 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2912  ABC transporter ATP-binding protein  58.08 
 
 		 366 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2681  ABC transporter related  59 
 
 		 372 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0244  ABC transporter related  59.23 
 
 		 369 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0220  ABC transporter ATP-binding protein  58.4 
 
 		 369 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333916  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0235  ABC transporter related  58.4 
 
 		 369 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1781  ABC transporter related  60.99 
 
 		 397 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4992  ABC transporter related  57.03 
 
 		 369 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7234  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.11 
 
 		 384 aa  358  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4225  ABC transporter related  57.55 
 
 		 384 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00831393 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  53.41 
 
 		 352 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  53.41 
 
 		 352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  54.6 
 
 		 337 aa  333  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1145  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.14 
 
 		 377 aa  333  5e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5613  ABC transporter related  60.13 
 
 		 388 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.309158  normal  0.370742 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3856  DL-methionine transporter subunit  67.07 
 
 		 274 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  50.62 
 
 		 340 aa  318  7e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  50.32 
 
 		 344 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1103  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  46.74 
 
 		 344 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  51.3 
 
 		 351 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6508  ABC transporter related  53.55 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2785  ABC transporter related  52.78 
 
 		 359 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3225  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.49 
 
 		 382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.71 
 
 		 348 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.71 
 
 		 348 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  50.16 
 
 		 342 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.96 
 
 		 344 aa  306  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6095  ABC transporter related  53.71 
 
 		 362 aa  307  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.733778 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  48.12 
 
 		 345 aa  306  3e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  47.16 
 
 		 343 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1610  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53 
 
 		 368 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0920  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.58 
 
 		 350 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0129  ABC D-methionine uptake transporter, ATPase subunit  51.97 
 
 		 353 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539804  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7230  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.99 
 
 		 355 aa  303  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.983063  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2419  ABC transporter component  63.2 
 
 		 258 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  47.95 
 
 		 342 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  53.44 
 
 		 354 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.74 
 
 		 345 aa  302  7.000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0790  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.25 
 
 		 349 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264335  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.25 
 
 		 349 aa  302  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3160  ABC transporter related  55.73 
 
 		 337 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2457  ABC transporter related  49.86 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.53 
 
 		 348 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255507  hitchhiker  0.00172815 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4331  NLPA lipoprotein  51.25 
 
 		 353 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0798419  normal  0.109457 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.16 
 
 		 344 aa  301  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.27 
 
 		 344 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.14 
 
 		 385 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0176  ABC transporter ATP-binding protein  48.43 
 
 		 346 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00383755  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0166  ABC transporter, ATP-binding protein  48.11 
 
 		 346 aa  300  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.766032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0198  ABC transporter, ATP-binding protein  46.65 
 
 		 346 aa  300  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1766  ABC transporter related  51.82 
 
 		 353 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0174  ABC transporter ATP-binding protein  48.43 
 
 		 346 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.157332  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.88 
 
 		 343 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.88 
 
 		 343 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.88 
 
 		 343 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0195  ABC transporter, ATP-binding protein  48.43 
 
 		 346 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.88 
 
 		 343 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.88 
 
 		 343 aa  298  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0218  ABC transporter, ATP-binding protein  47.48 
 
 		 346 aa  298  8e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.07 
 
 		 344 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.07 
 
 		 344 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2980  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.07 
 
 		 344 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.07 
 
 		 344 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0215  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.07 
 
 		 344 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2931  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.07 
 
 		 344 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2558  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.07 
 
 		 344 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.07 
 
 		 344 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.62 
 
 		 343 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  46.31 
 
 		 344 aa  298  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0737  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.59 
 
 		 343 aa  298  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00428338  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.88 
 
 		 344 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  47.17 
 
 		 339 aa  297  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5127  ABC transporter, ATP-binding protein  46.54 
 
 		 346 aa  296  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  46.54 
 
 		 339 aa  296  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  45.74 
 
 		 343 aa  296  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  48.9 
 
 		 341 aa  296  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3485  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.33 
 
 		 335 aa  296  5e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0563  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.91 
 
 		 356 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.31 
 
 		 343 aa  296  6e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.31 
 
 		 343 aa  296  6e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>