More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1908 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  74.95 
 
 
511 aa  780  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1921  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  99.63 
 
 
535 aa  1063  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  75.89 
 
 
506 aa  771  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  75.25 
 
 
506 aa  782  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  76.28 
 
 
506 aa  778  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1197  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  99.8 
 
 
506 aa  1007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2434  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  90.34 
 
 
540 aa  894  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.936114  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0857  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  99.81 
 
 
535 aa  1065  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2070  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  99.44 
 
 
859 aa  1056  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0501003  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0343  ABC transporter related  65.99 
 
 
497 aa  639  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1908  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
535 aa  1067  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00738158  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5464  ABC transporter related  77.08 
 
 
506 aa  757  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0303  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  99.81 
 
 
535 aa  1065  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0120484  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  73.95 
 
 
528 aa  753  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4819  ABC transporter related  77.08 
 
 
506 aa  757  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0757413  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1641  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  99.63 
 
 
534 aa  1061  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0578251  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3548  ABC transporter related  77.08 
 
 
506 aa  757  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650239  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  75.89 
 
 
506 aa  751  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2159  ABC transporter related  62.27 
 
 
500 aa  608  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.634503  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  59.39 
 
 
501 aa  600  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  59.6 
 
 
496 aa  578  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  59.6 
 
 
496 aa  578  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  59.6 
 
 
496 aa  578  1e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  7.61209e-05 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  46.4 
 
 
503 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  46.89 
 
 
504 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  45.58 
 
 
499 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  45.58 
 
 
499 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  46.09 
 
 
514 aa  424  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  43.55 
 
 
501 aa  417  1e-115  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  45.76 
 
 
512 aa  417  1e-115  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  46.45 
 
 
515 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  46.34 
 
 
514 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  46.34 
 
 
514 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  47.01 
 
 
514 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  43.08 
 
 
524 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  43.08 
 
 
524 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  45.4 
 
 
503 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  45.58 
 
 
520 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  45.29 
 
 
513 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  44.18 
 
 
524 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.09 
 
 
512 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  43.98 
 
 
524 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  45.07 
 
 
496 aa  409  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  46.06 
 
 
517 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.46 
 
 
527 aa  407  1e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  46.28 
 
 
503 aa  407  1e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  45.1 
 
 
501 aa  405  1e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  43.55 
 
 
524 aa  407  1e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  43.98 
 
 
524 aa  406  1e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  43.58 
 
 
492 aa  405  1e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  45 
 
 
524 aa  407  1e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  45.42 
 
 
508 aa  405  1e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  45.53 
 
 
516 aa  407  1e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  44.98 
 
 
514 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  45.18 
 
 
512 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.47 
 
 
492 aa  404  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.6 
 
 
497 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  45.18 
 
 
512 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  46.06 
 
 
497 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  45.78 
 
 
499 aa  404  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  44.65 
 
 
494 aa  402  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  45 
 
 
508 aa  405  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  45.29 
 
 
513 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  45.23 
 
 
513 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  41.26 
 
 
494 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  45.82 
 
 
505 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  44.1 
 
 
516 aa  399  1e-110  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  41.46 
 
 
496 aa  400  1e-110  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  9.97744e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  42.31 
 
 
498 aa  400  1e-110  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  42.51 
 
 
495 aa  396  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  43.69 
 
 
518 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  42.77 
 
 
494 aa  398  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  43.09 
 
 
499 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  45.58 
 
 
507 aa  398  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 
525 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  43.06 
 
 
521 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  44.71 
 
 
504 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  42.51 
 
 
513 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 
523 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  41.67 
 
 
509 aa  392  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  40.45 
 
 
494 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  43.63 
 
 
503 aa  390  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  1.10391e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.45 
 
 
494 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  41.85 
 
 
501 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  41.67 
 
 
520 aa  390  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  41.92 
 
 
513 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.45 
 
 
494 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  44.69 
 
 
503 aa  391  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  45.74 
 
 
508 aa  392  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  45.09 
 
 
510 aa  391  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  42.97 
 
 
500 aa  391  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  45.45 
 
 
495 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  45.23 
 
 
511 aa  391  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.45 
 
 
494 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  40.08 
 
 
525 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  41.47 
 
 
505 aa  388  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 
501 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  41.63 
 
 
512 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  39.36 
 
 
504 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  44.65 
 
 
505 aa  388  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>