34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4993 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4993  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  306  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  40.54 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  40.67 
 
 		 148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2164  hypothetical protein  43.17 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337472  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  39.19 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  41.3 
 
 		 151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  39.86 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3501  hypothetical protein  39.86 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  34.25 
 
 		 163 aa  93.6  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2873  hypothetical protein  37.16 
 
 		 151 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3884  hypothetical protein  37.41 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985147  normal  0.0815674 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  36.03 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7762  hypothetical protein  42.11 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.0323872 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2253  AtsE  30.34 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.797018  normal  0.537968 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  30.77 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  33.1 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  27.74 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  29.5 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2176  hypothetical protein  29.29 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  30.77 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0562  hypothetical protein  27.97 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2244  hypothetical protein  30.43 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  25.37 
 
 		 172 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  28.28 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  28.28 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0764  AtsE  28.06 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550753  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3609  hypothetical protein  24.29 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2451  hypothetical protein  34.15 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.616886 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0693  hypothetical protein  27.45 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03440  AtsE  29.37 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5481  hypothetical protein  27.21 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222259  normal  0.850056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5091  hypothetical protein  28.19 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6901  hypothetical protein  26.47 
 
 		 153 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2101  putative AtsE  27.78 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>