51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_51430 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_51430  Proton/sugar symporter  100 
 
 		 437 aa  875    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0632  galactoside permease  50 
 
 		 420 aa  388  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0846  galactoside permease  50.13 
 
 		 420 aa  385  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2657  galactoside permease  51.31 
 
 		 426 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1330  galactoside permease  51.31 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.800996  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3115  galactoside permease  48.54 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0255021 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3381  galactoside permease  48.81 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1767  galactoside permease  46.21 
 
 		 418 aa  361  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0531388  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2492  galactoside permease  47.86 
 
 		 435 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1680  galactoside permease  47.86 
 
 		 435 aa  360  3e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000567267  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1361  galactoside permease  47.63 
 
 		 420 aa  360  4e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.32292  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4076  galactoside permease  47.56 
 
 		 421 aa  358  9e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2394  galactoside permease  47.59 
 
 		 435 aa  358  9e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000789855  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0407  galactoside permease  46.32 
 
 		 417 aa  350  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00583816  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0416  galactoside permease  46.32 
 
 		 417 aa  350  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00297  galactoside permease  46.32 
 
 		 417 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0372048  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0374  galactoside permease  46.32 
 
 		 417 aa  350  3e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0367  galactoside permease  46.32 
 
 		 417 aa  350  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00932691  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3263  oligosaccharide/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  46.32 
 
 		 417 aa  350  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0568399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3282  galactoside permease  46.32 
 
 		 417 aa  350  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00177774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3102  major facilitator superfamily oligosaccharide/H+ symporter  47.63 
 
 		 418 aa  343  4e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.186561 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2636  oligosaccharide/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.32 
 
 		 410 aa  303  5.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232716  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3434  major facilitator superfamily oligosaccharide/H+ symporter  32.7 
 
 		 422 aa  261  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2083  galactoside permease  39.35 
 
 		 419 aa  253  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28670  galactoside permease  35.48 
 
 		 448 aa  227  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51800  galactoside permease  35.94 
 
 		 427 aa  224  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2646  galactoside permease  32.3 
 
 		 415 aa  223  6e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0124  galactoside permease  25.49 
 
 		 445 aa  153  7e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000688669  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  21.16 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  25.11 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  21.3 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0355  major facilitator superfamily permease  22.6 
 
 		 411 aa  50.4  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0427914  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 378 aa  49.7  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  20.98 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  21.85 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 392 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  21.09 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 		 452 aa  47.4  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6499  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 449 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1718  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2823  xanthosine transporter XapB  22.06 
 
 		 418 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  21.11 
 
 		 392 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2910  nucleoside transporter  22.06 
 
 		 418 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 385 aa  43.9  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  24.39 
 
 		 405 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3242  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 449 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  25.67 
 
 		 397 aa  43.1  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  19.6 
 
 		 388 aa  43.1  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>