More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_07410 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  80.35 
 
 
404 aa  647    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  79.1 
 
 
429 aa  639    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  100 
 
 
404 aa  793    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  80.6 
 
 
429 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  76.98 
 
 
418 aa  628  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  76.98 
 
 
418 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  76.87 
 
 
404 aa  627  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  72.07 
 
 
404 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  71.82 
 
 
415 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  71.32 
 
 
404 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  70.57 
 
 
404 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  62.59 
 
 
410 aa  500  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  59.85 
 
 
406 aa  496  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  60.35 
 
 
405 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  57.04 
 
 
410 aa  485  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  58.85 
 
 
408 aa  485  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  60.6 
 
 
405 aa  481  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  60.35 
 
 
405 aa  474  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  57.64 
 
 
404 aa  474  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  59.85 
 
 
405 aa  474  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  56.33 
 
 
438 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  58.56 
 
 
411 aa  463  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  55.31 
 
 
412 aa  458  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  57.71 
 
 
404 aa  457  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  53.88 
 
 
410 aa  439  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  52.76 
 
 
413 aa  428  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  53.09 
 
 
398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  49.63 
 
 
411 aa  331  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  46.35 
 
 
398 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  43.22 
 
 
407 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  43.22 
 
 
406 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  58.41 
 
 
435 aa  248  2e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  43.15 
 
 
420 aa  248  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  41.07 
 
 
414 aa  247  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  42.35 
 
 
403 aa  247  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  40.15 
 
 
419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  56.67 
 
 
400 aa  241  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  56.67 
 
 
400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  43.72 
 
 
429 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  38.68 
 
 
409 aa  236  4e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  40.79 
 
 
432 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  40.76 
 
 
406 aa  232  8.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  37.68 
 
 
409 aa  230  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  41.48 
 
 
419 aa  229  6e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1310  phosphoserine phosphatase SerB  50.84 
 
 
303 aa  226  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193327  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  38.81 
 
 
410 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  39.09 
 
 
421 aa  222  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  36.25 
 
 
400 aa  216  4e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4276  phosphoserine phosphatase SerB  40.2 
 
 
410 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  52.58 
 
 
281 aa  205  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2083  phosphoserine phosphatase SerB  39.3 
 
 
419 aa  203  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726973  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  50 
 
 
326 aa  202  9e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  46.43 
 
 
326 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  40.73 
 
 
306 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  40.73 
 
 
306 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  51.92 
 
 
326 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  51.92 
 
 
326 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  37.81 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  46.54 
 
 
306 aa  197  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  51.44 
 
 
326 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1853  phosphoserine phosphatase SerB  37.78 
 
 
417 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1834  phosphoserine phosphatase SerB  37.78 
 
 
417 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0739277  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1900  phosphoserine phosphatase SerB  37.78 
 
 
417 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
298 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  50.98 
 
 
322 aa  196  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  43.72 
 
 
302 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  49.59 
 
 
298 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  47.56 
 
 
322 aa  194  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  47.56 
 
 
322 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  47.56 
 
 
322 aa  194  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  47.56 
 
 
322 aa  194  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  47.56 
 
 
322 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  47.56 
 
 
322 aa  194  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  47.56 
 
 
322 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  47.56 
 
 
322 aa  194  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  47.11 
 
 
322 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  47.11 
 
 
322 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  47.11 
 
 
322 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  48.42 
 
 
297 aa  192  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  47.11 
 
 
322 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  47.11 
 
 
322 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  46.78 
 
 
325 aa  192  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  52.43 
 
 
223 aa  192  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  46.99 
 
 
298 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  50 
 
 
322 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  46.22 
 
 
325 aa  192  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  45.97 
 
 
281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  45.33 
 
 
325 aa  189  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  47.8 
 
 
328 aa  189  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40365  phosphoserine phosphatase activity  44.31 
 
 
306 aa  189  5.999999999999999e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.288179  normal  0.883376 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  44.89 
 
 
325 aa  189  7e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  46.22 
 
 
325 aa  189  9e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  43.55 
 
 
281 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0935  phosphoserine phosphatase  47.89 
 
 
224 aa  189  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  46.77 
 
 
316 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  46.77 
 
 
316 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  48.8 
 
 
284 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  45.8 
 
 
285 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  45.16 
 
 
279 aa  186  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  46.37 
 
 
281 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>