258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9135 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011984  Avi_9135  transposase  100 
 
 
180 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  89.83 
 
 
243 aa  330  8e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0563  transposase protein  85.88 
 
 
238 aa  320  6e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9042  transposase  87.72 
 
 
238 aa  317  4e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  87.72 
 
 
238 aa  318  4e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0546  transposase  84.75 
 
 
238 aa  315  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7074  transposase  85.88 
 
 
238 aa  315  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8012  transposase protein  85.96 
 
 
238 aa  311  3e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  76.05 
 
 
232 aa  264  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4725  transposase  70.56 
 
 
237 aa  262  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393822  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  73.05 
 
 
237 aa  260  8e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7470  transposase  89.08 
 
 
196 aa  216  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  60.82 
 
 
233 aa  206  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  58.99 
 
 
233 aa  205  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  57.8 
 
 
236 aa  205  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  58.99 
 
 
233 aa  203  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  58.99 
 
 
233 aa  203  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  58.99 
 
 
233 aa  203  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0561  transposase protein  56.98 
 
 
233 aa  195  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3113  transposase  59.2 
 
 
236 aa  182  2e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3283  transposase  59.2 
 
 
236 aa  182  2e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3173  transposase  59.2 
 
 
236 aa  182  2e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19085  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  52.3 
 
 
233 aa  176  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  51.96 
 
 
237 aa  171  8e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  51.96 
 
 
237 aa  171  8e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  51.96 
 
 
237 aa  171  8e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  51.96 
 
 
237 aa  171  8e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  51.96 
 
 
237 aa  171  8e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  51.96 
 
 
237 aa  171  8e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  51.96 
 
 
237 aa  171  8e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8446  putative transposase  51.74 
 
 
233 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7882  putative transposase  51.74 
 
 
233 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7848  putative transposase  51.74 
 
 
233 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7870  putative transposase  51.74 
 
 
233 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7844  putative transposase  51.74 
 
 
233 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  52.22 
 
 
231 aa  161  5e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  51.69 
 
 
232 aa  160  8e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1696  IS6 family transposase  49.43 
 
 
242 aa  158  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1165  putative IS element transposase  49.43 
 
 
242 aa  158  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1705  IS6 family transposase  49.43 
 
 
242 aa  158  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2794  ISRh1 transposase-like protein  49.43 
 
 
242 aa  158  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1481  transposase  52.66 
 
 
238 aa  158  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1495  transposase  52.66 
 
 
238 aa  158  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1485  transposase  52.66 
 
 
238 aa  158  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7541  transposase  77.17 
 
 
119 aa  157  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1703  IS6 family transposase  49.43 
 
 
242 aa  157  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0077  IS6 family transposase  49.43 
 
 
242 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1506  transposase  50.28 
 
 
238 aa  155  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8072  transposase  79.78 
 
 
94 aa  155  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2762  transposase  48.65 
 
 
251 aa  154  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297514  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2782  integrase catalytic subunit  51.67 
 
 
231 aa  152  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0856154  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8615  putative transposase  46.55 
 
 
233 aa  141  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  35.43 
 
 
226 aa  120  1e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  35.43 
 
 
226 aa  120  1e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  35.43 
 
 
226 aa  120  1e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  36.53 
 
 
226 aa  117  6e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  34.3 
 
 
226 aa  115  4e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D13  transposase  32.95 
 
 
236 aa  114  1e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  33.52 
 
 
226 aa  112  2e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  32.39 
 
 
226 aa  112  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  32.39 
 
 
226 aa  112  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  6.56405e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  33.72 
 
 
226 aa  112  4e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  33.14 
 
 
226 aa  112  4e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C12  transposase  32.39 
 
 
226 aa  110  8e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  32.95 
 
 
226 aa  110  1e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  32.57 
 
 
226 aa  108  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C41  transposase  32.57 
 
 
226 aa  107  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  32.77 
 
 
302 aa  105  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  32.77 
 
 
235 aa  105  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  41.29 
 
 
212 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  38.75 
 
 
236 aa  104  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  39.38 
 
 
236 aa  104  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  41.29 
 
 
213 aa  104  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  38.75 
 
 
237 aa  103  9e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  40 
 
 
236 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  38.12 
 
 
237 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  37.65 
 
 
224 aa  100  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  37.43 
 
 
254 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  36.61 
 
 
264 aa  98.6  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  37.43 
 
 
254 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  37.82 
 
 
213 aa  98.2  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  31.64 
 
 
235 aa  97.8  7e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2850  transposase  39.04 
 
 
211 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  40 
 
 
262 aa  94.4  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_52  transposase  31.35 
 
 
246 aa  94.4  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00159101  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0152  transposase  32.89 
 
 
164 aa  94  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0249  IS431mec-like transposase  29.94 
 
 
224 aa  94  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  30.77 
 
 
222 aa  93.6  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  35.52 
 
 
234 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  35.52 
 
 
240 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  33.33 
 
 
218 aa  92.4  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  35.52 
 
 
240 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  35.52 
 
 
234 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  35.52 
 
 
240 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  35.52 
 
 
240 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  35.52 
 
 
240 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  35.52 
 
 
240 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  35.52 
 
 
240 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  35.52 
 
 
240 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  35.52 
 
 
234 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>