33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8073 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8073  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  883    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0406  hypothetical protein  54.32 
 
 		 420 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4453  hypothetical protein  50.51 
 
 		 556 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000395035  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5524  hypothetical protein  51.37 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3301  hypothetical protein  51.72 
 
 		 424 aa  402  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3636  hypothetical protein  49.36 
 
 		 555 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3637  hypothetical protein  47.96 
 
 		 457 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4452  hypothetical protein  47.03 
 
 		 459 aa  388  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124037  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6279  hypothetical protein  44 
 
 		 441 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1126  hypothetical protein  42.79 
 
 		 460 aa  352  5e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1126  fibronectin type III domain-containing protein  43.29 
 
 		 733 aa  334  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3523  hypothetical protein  41.55 
 
 		 457 aa  332  7.000000000000001e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6055  Protein of unknown function DUF2329  31.57 
 
 		 474 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2684  putative secreted protein  28.44 
 
 		 534 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.791899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00879  hypothetical protein  29.17 
 
 		 525 aa  163  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173118  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2429  hypothetical protein  30.54 
 
 		 503 aa  162  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1016  hypothetical protein  29.32 
 
 		 505 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4068  hypothetical protein  29.24 
 
 		 929 aa  159  7e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.83009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1551  putative secreted protein  27.25 
 
 		 560 aa  155  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.423773  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1146  hypothetical protein  28.51 
 
 		 432 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1608  hypothetical protein  26.85 
 
 		 561 aa  152  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0531  hypothetical protein  28.54 
 
 		 450 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4543  hypothetical protein  29.61 
 
 		 423 aa  146  7.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483705  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4503  hypothetical protein  29.25 
 
 		 443 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0251  hypothetical protein  25.81 
 
 		 396 aa  136  7.000000000000001e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2992  hypothetical protein  29.56 
 
 		 439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0082  hypothetical protein  27.49 
 
 		 466 aa  133  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3133  hypothetical protein  28.64 
 
 		 427 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0763875  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  24.88 
 
 		 1967 aa  119  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2208  hypothetical protein  28.74 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3780  hypothetical protein  26.22 
 
 		 444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4109  hypothetical protein  26.1 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0080  hypothetical protein  27.03 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.815437  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>