More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3378 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_3378  acetyltransferase  100 
 
 
180 aa  363  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0929  GCN5-related N-acetyltransferase  76.65 
 
 
186 aa  278  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.568206 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  79.88 
 
 
186 aa  277  7e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2342  GCN5-related N-acetyltransferase  76.16 
 
 
180 aa  268  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3131  putative phosphinothricin N-acetyltransferase  70.93 
 
 
190 aa  262  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0992  GCN5-related N-acetyltransferase  61.85 
 
 
191 aa  216  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.552024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0955  GCN5-related N-acetyltransferase  60.69 
 
 
204 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4403  GCN5-related N-acetyltransferase  63.58 
 
 
192 aa  203  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0933  GCN5-related N-acetyltransferase  61.27 
 
 
204 aa  200  9e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0225  GCN5-related N-acetyltransferase  52 
 
 
193 aa  182  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296328 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1342  GCN5-related N-acetyltransferase  43.02 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327917  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1197  GCN5-related N-acetyltransferase  43.35 
 
 
184 aa  143  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1460  GCN5-related N-acetyltransferase  39.89 
 
 
178 aa  141  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3155  GCN5-related N-acetyltransferase  41.52 
 
 
179 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145568  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0012  GCN5-related N-acetyltransferase  43.58 
 
 
180 aa  138  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0867027 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  40.8 
 
 
176 aa  138  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0196  GCN5-related N-acetyltransferase  41.86 
 
 
176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695211  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1689  GCN5-related N-acetyltransferase  39.77 
 
 
178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0385  phosphinothricin acetyltransferase (PPT N-acetyltransferase)  41.52 
 
 
176 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3321  phosphinothricin N-acetyltransferase  40.46 
 
 
179 aa  134  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0173112  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00885  phosphinothricin N-acetyltransferase  40.78 
 
 
179 aa  134  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0203848  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1606  GCN5-related N-acetyltransferase  39.53 
 
 
180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0984019  normal  0.573216 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0238  GCN5-related N-acetyltransferase  43.02 
 
 
183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4882  GCN5-related N-acetyltransferase  39.53 
 
 
197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256707  normal  0.880249 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3435  GCN5-related N-acetyltransferase  39.2 
 
 
226 aa  132  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3735  GCN5-related N-acetyltransferase  38.29 
 
 
185 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1154  GCN5-related N-acetyltransferase  39.56 
 
 
186 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0181286  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1787  putative phosphinothricin N-acetyltransferase  38.95 
 
 
200 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000010061 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1472  Phosphinothricin acetyltransferase  39.88 
 
 
174 aa  130  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2530  phosphinothricin N-acetyltransferase  40.12 
 
 
247 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1274  phosphinothricin N-acetyltransferase  40.12 
 
 
247 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3365  GCN5-related N-acetyltransferase  41.86 
 
 
188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00313605  hitchhiker  0.0000000000000200087 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1352  phosphinothricin N-acetyltransferase  40.12 
 
 
247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4517  GCN5-related N-acetyltransferase  39.56 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.729154  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3122  Phosphinothricin acetyltransferase  36.99 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1401  GCN5-related N-acetyltransferase  38.37 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4059  GCN5-related N-acetyltransferase  37.91 
 
 
207 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0540643  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0284  phosphinothricin N-acetyltransferase  39.53 
 
 
247 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511587  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0554  phosphinothricin N-acetyltransferase  39.53 
 
 
247 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.450037  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1301  phosphinothricin N-acetyltransferase  39.53 
 
 
210 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1014  phosphinothricin N-acetyltransferase  39.53 
 
 
188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6053  GCN5-related N-acetyltransferase  38.64 
 
 
180 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134247  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3699  GCN5-related N-acetyltransferase  39.01 
 
 
186 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4669  GCN5-related N-acetyltransferase  39.01 
 
 
186 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.776305  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2704  GCN5-related N-acetyltransferase  39.53 
 
 
173 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1467  phosphinothricin N-acetyltransferase  40.12 
 
 
188 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0089  phosphinothricin N-acetyltransferase  39.11 
 
 
179 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32151  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0101  GCN5-related N-acetyltransferase  39.66 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3938  GCN5-related N-acetyltransferase  37.21 
 
 
181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0087  phosphinothricin N-acetyltransferase  39.11 
 
 
179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5631  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320484  normal  0.522089 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0201  GCN5-related N-acetyltransferase  42.2 
 
 
174 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3356  GCN5-related N-acetyltransferase  38.95 
 
 
173 aa  125  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378643 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0528  GCN5-related N-acetyltransferase  38.15 
 
 
181 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5346  GCN5-related N-acetyltransferase  37.57 
 
 
174 aa  125  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3272  GCN5-related N-acetyltransferase  38.51 
 
 
210 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1883  GCN5-related N-acetyltransferase  37.43 
 
 
197 aa  124  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.278862  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7237  GCN5-related N-acetyltransferase  38.86 
 
 
182 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.354809  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4023  GCN5-related N-acetyltransferase  39.77 
 
 
186 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210755  normal  0.806566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  39.31 
 
 
205 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104009  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2866  GCN5-related N-acetyltransferase  37.57 
 
 
195 aa  122  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0345136 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4724  GCN5-related N-acetyltransferase  40.24 
 
 
182 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0556271 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3647  GCN5-related N-acetyltransferase  40.24 
 
 
182 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1103  putative phosphinothricin acetyltransferase  38.98 
 
 
190 aa  121  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0397  phosphinothricin acetyltransferase protein  39.16 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.456114  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4058  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4184  acetyltransferase  37.43 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3437  GCN5-related N-acetyltransferase  36.21 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3354  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3077  GCN5-related N-acetyltransferase  37.21 
 
 
185 aa  117  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2931  Phosphinothricin acetyltransferase  34.48 
 
 
178 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2733  GCN5-related N-acetyltransferase  37.21 
 
 
184 aa  115  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5489  GCN5-related N-acetyltransferase  38.37 
 
 
176 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385408  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2779  GCN5-related N-acetyltransferase  37.2 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229182  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3361  GCN5-related N-acetyltransferase  35.15 
 
 
168 aa  108  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350433  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1369  Phosphinothricin acetyltransferase  36.67 
 
 
177 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1899  GCN5-related N-acetyltransferase  37.35 
 
 
167 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0856381  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1356  GCN5-related N-acetyltransferase  33.94 
 
 
181 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.181273  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2407  GCN5-related N-acetyltransferase  37.99 
 
 
195 aa  106  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5144  Phosphinothricin acetyltransferase  35.76 
 
 
170 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324669  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0680  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
186 aa  104  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2090  phosphinothricin acetyltransferase, putative  37.72 
 
 
164 aa  103  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3492  GCN5-related N-acetyltransferase  37.13 
 
 
171 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2552  GCN5-related N-acetyltransferase  36.75 
 
 
163 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2604  GCN5-related N-acetyltransferase  36.75 
 
 
163 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1276  phosphinothricin acetyltransferase, putative  32.32 
 
 
170 aa  101  7e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3167  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
171 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0386  Phosphinothricin acetyltransferase  42.4 
 
 
173 aa  100  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4064  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 
169 aa  98.6  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1827  phosphinothricin N-acetyltransferase  32.34 
 
 
163 aa  98.6  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3760  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
182 aa  98.2  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4837  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
182 aa  98.2  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3133  putative antibiotic resistance (acetyltransferase) protein  42.98 
 
 
182 aa  97.8  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2159  GCN5-related N-acetyltransferase  38.93 
 
 
184 aa  97.8  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147439  normal  0.386853 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1274  Phosphinothricin acetyltransferase  37.27 
 
 
168 aa  96.3  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768034  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4258  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 
182 aa  95.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257172  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3636  GCN5-related N-acetyltransferase  34.12 
 
 
165 aa  95.1  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3983  GCN5-related N-acetyltransferase  38.06 
 
 
178 aa  94.7  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4724  GCN5-related N-acetyltransferase  34.91 
 
 
171 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375427 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1725  acetyltransferase  34.76 
 
 
172 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000562438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>