More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1472 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_1472  Phosphinothricin acetyltransferase  100 
 
 
174 aa  358  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2704  GCN5-related N-acetyltransferase  77.06 
 
 
173 aa  277  7e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3356  GCN5-related N-acetyltransferase  77.06 
 
 
173 aa  276  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378643 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1883  GCN5-related N-acetyltransferase  76.02 
 
 
197 aa  271  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.278862  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3938  GCN5-related N-acetyltransferase  68.97 
 
 
181 aa  259  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1689  GCN5-related N-acetyltransferase  69.82 
 
 
178 aa  253  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5346  GCN5-related N-acetyltransferase  70.93 
 
 
174 aa  251  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1460  GCN5-related N-acetyltransferase  68.05 
 
 
178 aa  248  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1401  GCN5-related N-acetyltransferase  69.54 
 
 
174 aa  247  5e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0680  GCN5-related N-acetyltransferase  56.65 
 
 
186 aa  188  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1342  GCN5-related N-acetyltransferase  53.18 
 
 
185 aa  187  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327917  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1103  putative phosphinothricin acetyltransferase  52.63 
 
 
190 aa  184  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0012  GCN5-related N-acetyltransferase  51.74 
 
 
180 aa  181  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0867027 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0528  GCN5-related N-acetyltransferase  49.42 
 
 
181 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3155  GCN5-related N-acetyltransferase  48.54 
 
 
179 aa  177  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145568  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1197  GCN5-related N-acetyltransferase  49.71 
 
 
184 aa  176  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3435  GCN5-related N-acetyltransferase  48.52 
 
 
226 aa  174  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0201  GCN5-related N-acetyltransferase  50.29 
 
 
174 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2530  phosphinothricin N-acetyltransferase  50.89 
 
 
247 aa  174  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1274  phosphinothricin N-acetyltransferase  50.89 
 
 
247 aa  174  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1352  phosphinothricin N-acetyltransferase  50.89 
 
 
247 aa  174  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3365  GCN5-related N-acetyltransferase  52.07 
 
 
188 aa  174  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00313605  hitchhiker  0.0000000000000200087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3321  phosphinothricin N-acetyltransferase  48.26 
 
 
179 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0173112  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1014  phosphinothricin N-acetyltransferase  50.3 
 
 
188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1301  phosphinothricin N-acetyltransferase  50.3 
 
 
210 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  50.58 
 
 
205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104009  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0284  phosphinothricin N-acetyltransferase  50.3 
 
 
247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511587  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0554  phosphinothricin N-acetyltransferase  50.3 
 
 
247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.450037  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0196  GCN5-related N-acetyltransferase  48.82 
 
 
176 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695211  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4023  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
186 aa  169  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210755  normal  0.806566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0385  phosphinothricin acetyltransferase (PPT N-acetyltransferase)  47.95 
 
 
176 aa  169  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1467  phosphinothricin N-acetyltransferase  49.11 
 
 
188 aa  169  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1899  GCN5-related N-acetyltransferase  50.61 
 
 
167 aa  169  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0856381  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0238  GCN5-related N-acetyltransferase  49.7 
 
 
183 aa  168  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4184  acetyltransferase  48.57 
 
 
209 aa  167  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4882  GCN5-related N-acetyltransferase  47.65 
 
 
197 aa  167  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256707  normal  0.880249 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1606  GCN5-related N-acetyltransferase  47.34 
 
 
180 aa  166  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0984019  normal  0.573216 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2931  Phosphinothricin acetyltransferase  48.26 
 
 
178 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2866  GCN5-related N-acetyltransferase  47.37 
 
 
195 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0345136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6053  GCN5-related N-acetyltransferase  46.51 
 
 
180 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134247  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1154  GCN5-related N-acetyltransferase  49.11 
 
 
186 aa  164  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0181286  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0087  phosphinothricin N-acetyltransferase  49.71 
 
 
179 aa  164  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0089  phosphinothricin N-acetyltransferase  49.71 
 
 
179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32151  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1787  putative phosphinothricin N-acetyltransferase  47.06 
 
 
200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000010061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7237  GCN5-related N-acetyltransferase  44.19 
 
 
182 aa  160  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.354809  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3699  GCN5-related N-acetyltransferase  47.09 
 
 
186 aa  160  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4669  GCN5-related N-acetyltransferase  47.09 
 
 
186 aa  160  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.776305  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5631  GCN5-related N-acetyltransferase  47.09 
 
 
186 aa  160  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320484  normal  0.522089 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3122  Phosphinothricin acetyltransferase  46.51 
 
 
176 aa  159  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0101  GCN5-related N-acetyltransferase  47.95 
 
 
193 aa  159  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4517  GCN5-related N-acetyltransferase  47.93 
 
 
187 aa  158  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.729154  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4059  GCN5-related N-acetyltransferase  47.34 
 
 
207 aa  157  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0540643  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3272  GCN5-related N-acetyltransferase  48.57 
 
 
210 aa  156  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3735  GCN5-related N-acetyltransferase  44 
 
 
185 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3354  GCN5-related N-acetyltransferase  45.09 
 
 
186 aa  156  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3077  GCN5-related N-acetyltransferase  46.55 
 
 
185 aa  155  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3647  GCN5-related N-acetyltransferase  46.67 
 
 
182 aa  154  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4724  GCN5-related N-acetyltransferase  46.67 
 
 
182 aa  154  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0556271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5489  GCN5-related N-acetyltransferase  47.13 
 
 
176 aa  154  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385408  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0397  phosphinothricin acetyltransferase protein  47.56 
 
 
183 aa  154  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.456114  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1369  Phosphinothricin acetyltransferase  49.02 
 
 
177 aa  153  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3437  GCN5-related N-acetyltransferase  46.82 
 
 
206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3361  GCN5-related N-acetyltransferase  47.85 
 
 
168 aa  151  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350433  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4058  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
200 aa  150  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  42.77 
 
 
176 aa  147  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2407  GCN5-related N-acetyltransferase  46.63 
 
 
195 aa  147  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1356  GCN5-related N-acetyltransferase  42.07 
 
 
181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.181273  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2733  GCN5-related N-acetyltransferase  40.46 
 
 
184 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3131  putative phosphinothricin N-acetyltransferase  39.31 
 
 
190 aa  140  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0225  GCN5-related N-acetyltransferase  40.94 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296328 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3378  acetyltransferase  39.77 
 
 
180 aa  137  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00885  phosphinothricin N-acetyltransferase  42.77 
 
 
179 aa  135  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0203848  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0992  GCN5-related N-acetyltransferase  40.8 
 
 
191 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.552024 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0929  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
186 aa  134  7.000000000000001e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.568206 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1276  phosphinothricin acetyltransferase, putative  42.33 
 
 
170 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0955  GCN5-related N-acetyltransferase  40.23 
 
 
204 aa  131  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3655  Phosphinothricin acetyltransferase  39.88 
 
 
168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0933  GCN5-related N-acetyltransferase  41.95 
 
 
204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4403  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 
192 aa  129  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5144  Phosphinothricin acetyltransferase  38.27 
 
 
170 aa  124  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324669  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  36.97 
 
 
186 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4064  GCN5-related N-acetyltransferase  41.1 
 
 
169 aa  124  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0386  Phosphinothricin acetyltransferase  41.32 
 
 
173 aa  123  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1861  GCN5-related N-acetyltransferase  40.57 
 
 
177 aa  121  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2342  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
180 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2457  GCN5-related N-acetyltransferase  35.33 
 
 
167 aa  120  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21300  sortase-like acyltransferase  39.55 
 
 
210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1827  phosphinothricin N-acetyltransferase  38.04 
 
 
163 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1596  acetyltransferase  40.48 
 
 
202 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1649  acetyltransferase  40.48 
 
 
164 aa  115  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.336507  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1268  GCN5-related N-acetyltransferase  40.48 
 
 
164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0287  GCN5-related N-acetyltransferase  35.76 
 
 
184 aa  114  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2779  GCN5-related N-acetyltransferase  33.94 
 
 
165 aa  114  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229182  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3298  GCN5-related N-acetyltransferase  38.04 
 
 
185 aa  111  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000192346  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2552  GCN5-related N-acetyltransferase  38.99 
 
 
163 aa  111  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2604  GCN5-related N-acetyltransferase  38.99 
 
 
163 aa  111  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1935  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
199 aa  110  9e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.775828  normal  0.0634472 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1335  sortase related acyltransferase  34.97 
 
 
177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000322304  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1921  Phosphinothricin acetyltransferase  36.81 
 
 
165 aa  108  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2571  phosphinothricin N-acetyltransferase  33.76 
 
 
169 aa  104  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>