More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2861 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  100 
 
 		 154 aa  314  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  96.1 
 
 		 154 aa  303  7e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  94.12 
 
 		 156 aa  297  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  94.12 
 
 		 156 aa  297  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  50.32 
 
 		 158 aa  174  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  50.32 
 
 		 155 aa  174  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  52.82 
 
 		 155 aa  174  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  50.98 
 
 		 158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  50.98 
 
 		 158 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  47.74 
 
 		 155 aa  170  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  48.39 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  51.85 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  47.01 
 
 		 161 aa  151  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  47.62 
 
 		 155 aa  151  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  51.41 
 
 		 157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  49.23 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  49.23 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  43.84 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  47.62 
 
 		 157 aa  143  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1795  putative CheW protein  47.69 
 
 		 152 aa  143  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  46.76 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  44.06 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  38.51 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  47.41 
 
 		 162 aa  134  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  37.06 
 
 		 205 aa  113  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  34.29 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  33.11 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  33.12 
 
 		 167 aa  111  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  38.46 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  38.46 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  38.1 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  36.92 
 
 		 175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  33.79 
 
 		 169 aa  110  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  34.25 
 
 		 171 aa  110  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  31.21 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  31.21 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  31.91 
 
 		 165 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  30.14 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  34.07 
 
 		 167 aa  107  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  31.47 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  31.21 
 
 		 164 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  36.62 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  31.21 
 
 		 170 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  31.21 
 
 		 164 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  34.07 
 
 		 161 aa  107  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.71 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  31.79 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  31.79 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  31.79 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  31.79 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  31.79 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  31.39 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  31.39 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  31.39 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  28.28 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  33.56 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  31.39 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  31.39 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  31.39 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  31.39 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  31.39 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  31.39 
 
 		 165 aa  104  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  31.11 
 
 		 174 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  30.5 
 
 		 170 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  31.39 
 
 		 165 aa  104  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  31.39 
 
 		 165 aa  104  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  29.45 
 
 		 161 aa  104  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  27.81 
 
 		 165 aa  103  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  29.45 
 
 		 163 aa  103  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  30.41 
 
 		 163 aa  103  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  30.37 
 
 		 171 aa  103  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  28.28 
 
 		 163 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  28.28 
 
 		 163 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  33.77 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  29.63 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  31.51 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  30.94 
 
 		 174 aa  102  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  29.63 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  29.2 
 
 		 165 aa  102  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  29.63 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  29.63 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  29.63 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  29.2 
 
 		 165 aa  102  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  29.93 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  29.93 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  29.93 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  29.93 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  29.93 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  29.93 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  31.88 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  35.06 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  30.34 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  29.93 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  27.81 
 
 		 165 aa  101  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  29.25 
 
 		 175 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  30.66 
 
 		 167 aa  101  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  30.66 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  30 
 
 		 163 aa  101  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  33.1 
 
 		 168 aa  100  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  33.58 
 
 		 163 aa  100  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>